17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0326 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0326  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 262 aa  535  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0213  TPR repeat-containing protein  50.58 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09778  hypothetical protein  46.33 
 
 		 257 aa  208  8e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.685186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5454  Tetratricopeptide domain protein  33.33 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3815  Tetratricopeptide domain protein  36.92 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_002950  PG1430  TPR domain-containing protein  32.86 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.480041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.18 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0496  hypothetical protein  33.66 
 
 		 208 aa  106  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0533  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.02 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000139229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  32.12 
 
 		 213 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1798  Tetratricopeptide domain protein  31.62 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1348  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 221 aa  52.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0480  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1777  Tetratricopeptide domain protein  25.53 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0512  XRE family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 419 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4702  transcriptional activator  28.57 
 
 		 419 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00084826 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0725  transcriptional activator  29.7 
 
 		 419 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>