18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0496 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0496  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  424  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.32 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3815  Tetratricopeptide domain protein  37.56 
 
 
233 aa  141  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  36.02 
 
 
213 aa  132  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5454  Tetratricopeptide domain protein  30.65 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0326  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
262 aa  106  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0533  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.64 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000139229 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0213  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
259 aa  92.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1430  TPR domain-containing protein  32.8 
 
 
228 aa  92  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.480041 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09778  hypothetical protein  38.41 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.685186  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1798  Tetratricopeptide domain protein  31.72 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1657  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.88 
 
 
233 aa  61.2  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1777  Tetratricopeptide domain protein  23.91 
 
 
228 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0705  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
226 aa  51.6  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1348  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
352 aa  48.1  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.29 
 
 
1000 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  31.93 
 
 
1213 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>