15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0705 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0705  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
226 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2069  TPR repeat  53.98 
 
 
230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1800  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  56.64 
 
 
227 aa  205  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1348  TPR repeat-containing protein  48.62 
 
 
221 aa  191  7e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0480  TPR repeat-containing protein  46.58 
 
 
230 aa  174  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1777  Tetratricopeptide domain protein  38.94 
 
 
228 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1657  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.19 
 
 
233 aa  119  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  27.81 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1798  Tetratricopeptide domain protein  32.06 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0533  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.52 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000139229 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0496  hypothetical protein  29.19 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 
231 aa  61.6  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5454  Tetratricopeptide domain protein  23.91 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0326  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  32.43 
 
 
248 aa  42  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>