18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0480 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0480  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 230 aa  464  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0705  TPR repeat-containing protein  46.58 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1800  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.67 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1348  TPR repeat-containing protein  43.46 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2069  TPR repeat  44.89 
 
 		 230 aa  158  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1777  Tetratricopeptide domain protein  36.57 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1657  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.38 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1798  Tetratricopeptide domain protein  27.54 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0326  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 262 aa  62  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0533  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.72 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000139229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.87 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  24.19 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5454  Tetratricopeptide domain protein  23.76 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0213  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0496  hypothetical protein  22.09 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3815  Tetratricopeptide domain protein  24.88 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.08 
 
 		 1000 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09778  hypothetical protein  27.63 
 
 		 257 aa  42  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.685186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>