19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1800 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1800  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0705  TPR repeat-containing protein  56.64 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2069  TPR repeat  53.98 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1348  TPR repeat-containing protein  48.4 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0480  TPR repeat-containing protein  46.67 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1777  Tetratricopeptide domain protein  40.49 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1657  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.87 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1798  Tetratricopeptide domain protein  36.18 
 
 		 235 aa  85.1  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0496  hypothetical protein  26.23 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0533  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.72 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000139229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3815  Tetratricopeptide domain protein  25.12 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2078  TPR domain-containing protein  22.32 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  23.53 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_002950  PG1430  TPR domain-containing protein  24.23 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.480041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0363  Tetratricopeptide TPR_3  31.3 
 
 		 602 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.3 
 
 		 1000 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5454  Tetratricopeptide domain protein  22.5 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0326  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 262 aa  43.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>