89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2529 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  91.57 
 
 		 414 aa  777    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  89.4 
 
 		 415 aa  768    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  89.18 
 
 		 414 aa  756    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  98.31 
 
 		 415 aa  832    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  80.48 
 
 		 415 aa  688    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 415 aa  841    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  99.28 
 
 		 415 aa  837    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  90.12 
 
 		 415 aa  771    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  89.4 
 
 		 415 aa  766    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  74.7 
 
 		 415 aa  651    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  93.01 
 
 		 415 aa  773    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  72.44 
 
 		 419 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  72.5 
 
 		 415 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  71.95 
 
 		 419 aa  595  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  69.16 
 
 		 415 aa  589  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  70.4 
 
 		 416 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  43.18 
 
 		 419 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  41.26 
 
 		 431 aa  305  9.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  40.71 
 
 		 423 aa  299  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  29.94 
 
 		 400 aa  144  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  30.41 
 
 		 390 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  30.06 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  25.24 
 
 		 407 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  25.12 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  27.98 
 
 		 441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  27.47 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  24.38 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  23.9 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  25.94 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  19.94 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  24.33 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 3172 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  21.47 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  24.29 
 
 		 1040 aa  57  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  24.39 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  32.91 
 
 		 223 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  23.7 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 4079 aa  53.9  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 		 1094 aa  53.5  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 393 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 878 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.08 
 
 		 1288 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 		 3301 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 602 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  22.02 
 
 		 992 aa  50.4  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.7 
 
 		 758 aa  50.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.63 
 
 		 573 aa  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 3035 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.69 
 
 		 1186 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 4489 aa  49.7  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 344 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 750 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 392 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 		 833 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2819  hypothetical protein  27.74 
 
 		 471 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70664  hitchhiker  0.00000273831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1620  hypothetical protein  19.67 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.583527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 883 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 465 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 3560 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 1297 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.15 
 
 		 676 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.73 
 
 		 214 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 610 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 924 aa  46.6  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  21.62 
 
 		 1276 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.93 
 
 		 810 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.86 
 
 		 573 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  25.84 
 
 		 955 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 610 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  21.89 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6365  hypothetical protein  22.1 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0654356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1713  hypothetical protein  22.1 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.03 
 
 		 730 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.37 
 
 		 2240 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1728  hypothetical protein  22.1 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411446  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2153  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.569131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 		 673 aa  44.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 265 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.61 
 
 		 231 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  22.04 
 
 		 396 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 258 aa  43.5  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.04 
 
 		 564 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1140  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 605 aa  42.7  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>