246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2383 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 245 aa  502  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.57 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  39.04 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.75 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  36.89 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  34.94 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  36.29 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  32.65 
 
 		 255 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0400  putative lipoprotein  32.18 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  34.48 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1201  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.36 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00280103  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.07 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  28.5 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  26.24 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1139  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.43 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992241  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  25.79 
 
 		 258 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.47 
 
 		 306 aa  88.6  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.96 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.42 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  29.27 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  25.34 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.81 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  25.9 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  25.58 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  26.34 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1325  putative lipoprotein  27.64 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116814  hitchhiker  0.00388547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.65 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  24.65 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  22.99 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  25.98 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  26.38 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  25.71 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  26.94 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  29.17 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2876  putative transmembrane protein  26 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.676791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  22.44 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  24.88 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  20.47 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.31 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.11 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.11 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  27.54 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  25.71 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  22.13 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  23.85 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  26.07 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  23.85 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  22.41 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.57 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  28.49 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  28.49 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  26.63 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  24.38 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  22.22 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3500  putative transmembrane protein  29.47 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.9 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  24.58 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  27.33 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  22.64 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  27.33 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  25.22 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  24.9 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2179  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.39 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.73 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.73 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.73 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.54 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.36 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.36 
 
 		 285 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  26.5 
 
 		 300 aa  68.6  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4641  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.87 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.47 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1864  putative transmembrane protein  26.64 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  26.67 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  27.64 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  24.6 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  26.4 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  24.36 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000151596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  23.58 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.27 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  23.19 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4485  putative transmembrane protein  27.32 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  24.24 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  25.93 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  26.27 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  23.65 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  23.81 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  25.59 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  21.76 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0663  outer membrane protein  25.65 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000502796  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  24.04 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  21.72 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  22.69 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2004  putative transmembrane protein  23.91 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.519821  normal  0.271041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>