227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2055 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  100 
 
 		 255 aa  532  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  37 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  36.95 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1201  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  37.31 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00280103  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.98 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  36.97 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0400  putative lipoprotein  36.9 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  35.59 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  37.08 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1139  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  36.82 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992241  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1325  putative lipoprotein  35.98 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116814  hitchhiker  0.00388547 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  31.94 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  32.65 
 
 		 245 aa  125  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.33 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.91 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  31.16 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  35.42 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  28.82 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  32.02 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  35.33 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.58 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  34.29 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  27.31 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  28 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  26.05 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  29 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  29.86 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.52 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.8 
 
 		 299 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.3 
 
 		 285 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.11 
 
 		 306 aa  99.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  26.48 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.85 
 
 		 262 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  31.46 
 
 		 278 aa  99  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.85 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3144  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  29.72 
 
 		 244 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.64 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.64 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.64 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  26.29 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  33.87 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  28.82 
 
 		 288 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.64 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  28.57 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  29.02 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  26.15 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  30.66 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004395  probable component of the lipoprotein assembly complex (forms a complex with YaeT YfgL and NlpB)  26.55 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.64 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.2 
 
 		 243 aa  96.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  30.35 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.2 
 
 		 243 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.2 
 
 		 243 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  26.34 
 
 		 282 aa  96.3  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.76 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01004  hypothetical protein  26.87 
 
 		 242 aa  96.3  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  26.2 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.2 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  26.2 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.2 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.2 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.2 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 262 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.2 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.2 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.2 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  24.68 
 
 		 253 aa  95.5  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  26.7 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  27.32 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  25.59 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  26.27 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  25.59 
 
 		 287 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.33 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  27.13 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  31.63 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  24.77 
 
 		 301 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  26.07 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  27.06 
 
 		 291 aa  92.4  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  26.81 
 
 		 283 aa  92  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000151596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  27.68 
 
 		 288 aa  91.7  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  29.19 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  25.24 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  28.02 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0237  putative lipoprotein  27.96 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.558058  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.23 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  22.37 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  24.67 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.89 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  25.39 
 
 		 293 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  24.87 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>