78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1052 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  47.28 
 
 		 1024 aa  905    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1052  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1019 aa  2083    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1962  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1031 aa  465  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1538  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 1012 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0101738  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1172  Tetratricopeptide domain protein  28.3 
 
 		 1005 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 1023 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1004 aa  324  5e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  24.34 
 
 		 1006 aa  318  4e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.08 
 
 		 1001 aa  304  4.0000000000000003e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.08 
 
 		 1000 aa  168  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1651  TPR domain-containing protein  21.73 
 
 		 995 aa  162  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.874566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.32 
 
 		 4079 aa  64.7  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  24.03 
 
 		 747 aa  61.6  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2960  cellulose binding, type IV  25.69 
 
 		 952 aa  60.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 257 aa  57.4  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.22 
 
 		 1979 aa  56.2  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 264 aa  56.2  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 602 aa  55.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  20.97 
 
 		 1069 aa  54.7  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  25.13 
 
 		 719 aa  54.3  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  21.93 
 
 		 1073 aa  53.5  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2960  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1154 aa  53.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 312 aa  52.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3602  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 345 aa  52  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.310162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  22.5 
 
 		 715 aa  51.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  31.09 
 
 		 255 aa  50.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.83 
 
 		 707 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  27.96 
 
 		 275 aa  50.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  23.29 
 
 		 573 aa  49.7  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.58 
 
 		 561 aa  49.3  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26.58 
 
 		 561 aa  49.3  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  23.08 
 
 		 239 aa  49.3  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 		 621 aa  48.5  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 308 aa  48.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 		 927 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 804 aa  47.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.6 
 
 		 1067 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 287 aa  47.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  29.67 
 
 		 258 aa  46.6  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.99 
 
 		 938 aa  47  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000435275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  25.98 
 
 		 248 aa  47  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  24.37 
 
 		 267 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.99 
 
 		 288 aa  47  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  23.93 
 
 		 614 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  24.26 
 
 		 268 aa  47  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  24.26 
 
 		 282 aa  47  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 567 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  29.41 
 
 		 254 aa  46.2  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  24.26 
 
 		 282 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  22.64 
 
 		 333 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  27.78 
 
 		 307 aa  46.2  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  24.26 
 
 		 282 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  26.8 
 
 		 272 aa  46.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  21.63 
 
 		 1261 aa  46.2  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 615 aa  46.2  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 350 aa  45.8  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  23.87 
 
 		 621 aa  45.8  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  25.95 
 
 		 283 aa  45.8  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000151596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25 
 
 		 733 aa  45.8  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  23.14 
 
 		 730 aa  45.8  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  22.66 
 
 		 252 aa  45.8  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  23.87 
 
 		 621 aa  45.8  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  28.29 
 
 		 573 aa  45.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.63 
 
 		 573 aa  45.8  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  27.72 
 
 		 222 aa  45.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  21.23 
 
 		 1056 aa  45.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 544 aa  45.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  29.82 
 
 		 325 aa  45.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 393 aa  45.4  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  23.99 
 
 		 576 aa  45.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.34 
 
 		 248 aa  45.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  25.38 
 
 		 253 aa  45.1  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 		 1276 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 409 aa  45.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  26.42 
 
 		 322 aa  44.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  21.9 
 
 		 391 aa  44.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 568 aa  44.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>