31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2960 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2960  cellulose binding, type IV  100 
 
 		 952 aa  1954    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3566  coenzyme A biosynthesis protein  33.92 
 
 		 957 aa  507  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1813  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 952 aa  425  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1225  hypothetical protein  31.98 
 
 		 941 aa  386  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0439  Tetratricopeptide domain protein  30.4 
 
 		 1090 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0542  hypothetical protein  28.77 
 
 		 922 aa  363  8e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3076  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 1108 aa  360  9e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1229  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1016 aa  288  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.748097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1601  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 939 aa  177  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3961  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.1 
 
 		 1058 aa  127  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357683  normal  0.258592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3386  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 1162 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.4 
 
 		 1192 aa  69.3  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215973  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3322  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 		 1193 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3466  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 1191 aa  65.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.25 
 
 		 1000 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1052  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1019 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  28.73 
 
 		 1101 aa  56.6  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2491  Tetratricopeptide repeat protein  20.58 
 
 		 1155 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 441 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 		 441 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1518  TPR domain-containing protein  25.42 
 
 		 258 aa  48.1  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3603  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 		 304 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3712  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 		 304 aa  47.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.15 
 
 		 577 aa  47  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 468 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  23.91 
 
 		 648 aa  45.8  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6495  Tetratricopeptide repeat protein  21.73 
 
 		 1202 aa  45.8  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 		 3301 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2382  photosystem I assembly protein Ycf3  29.41 
 
 		 173 aa  45.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 878 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  28.26 
 
 		 269 aa  44.3  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>