14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3322 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3322  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1193 aa  2401    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3386  TPR repeat-containing protein  69.51 
 
 		 1162 aa  1621    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  97.32 
 
 		 1192 aa  2205    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215973  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3466  TPR repeat-containing protein  96.14 
 
 		 1191 aa  2225    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2491  Tetratricopeptide repeat protein  27.66 
 
 		 1155 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3961  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.76 
 
 		 1058 aa  231  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357683  normal  0.258592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0439  Tetratricopeptide domain protein  22.64 
 
 		 1090 aa  93.6  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1225  hypothetical protein  27.4 
 
 		 941 aa  81.6  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3076  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 1108 aa  79  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0542  hypothetical protein  25.04 
 
 		 922 aa  75.1  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2960  cellulose binding, type IV  21.86 
 
 		 952 aa  65.5  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1813  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 		 952 aa  57.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6495  Tetratricopeptide repeat protein  20.28 
 
 		 1202 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3566  coenzyme A biosynthesis protein  19.39 
 
 		 957 aa  46.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.759534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>