77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3961 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3961  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 1058 aa  2118    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357683  normal  0.258592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3386  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1162 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3466  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 1191 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.25 
 
 		 1192 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215973  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3322  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1193 aa  230  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2491  Tetratricopeptide repeat protein  24.47 
 
 		 1155 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3566  coenzyme A biosynthesis protein  25.37 
 
 		 957 aa  159  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2960  cellulose binding, type IV  22.1 
 
 		 952 aa  126  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0542  hypothetical protein  23.9 
 
 		 922 aa  121  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3076  TPR repeat-containing protein  21.25 
 
 		 1108 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0439  Tetratricopeptide domain protein  22.37 
 
 		 1090 aa  110  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6495  Tetratricopeptide repeat protein  22.78 
 
 		 1202 aa  104  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1813  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 952 aa  92  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1225  hypothetical protein  25.05 
 
 		 941 aa  89.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3304  Tetratricopeptide repeat protein  29.07 
 
 		 433 aa  87.4  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0969  hypothetical protein  30.8 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0985  hypothetical protein  33.85 
 
 		 361 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0982  hypothetical protein  33.17 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0926  hypothetical protein  34.67 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25.44 
 
 		 725 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.31 
 
 		 1000 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  22.94 
 
 		 782 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1601  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 		 939 aa  56.2  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  35.48 
 
 		 269 aa  55.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  35.48 
 
 		 269 aa  55.5  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  35.48 
 
 		 269 aa  55.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0248  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 793 aa  53.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  27.34 
 
 		 263 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  27.34 
 
 		 263 aa  52  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  29.46 
 
 		 272 aa  52.4  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  27.34 
 
 		 263 aa  52  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  27.34 
 
 		 263 aa  52.4  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  27.34 
 
 		 263 aa  52  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  27.34 
 
 		 263 aa  52  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  27.34 
 
 		 263 aa  52  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  27.34 
 
 		 263 aa  52  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  27.34 
 
 		 263 aa  52  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1229  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 1016 aa  51.6  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.748097  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  26.56 
 
 		 262 aa  50.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  28.02 
 
 		 689 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.37 
 
 		 828 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  27.78 
 
 		 264 aa  51.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  29.76 
 
 		 236 aa  50.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 		 258 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  26.56 
 
 		 262 aa  50.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  26.56 
 
 		 262 aa  50.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 312 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  30.12 
 
 		 269 aa  49.3  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 435 aa  48.9  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 		 1060 aa  48.9  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  30.95 
 
 		 258 aa  48.1  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  32.67 
 
 		 242 aa  48.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  28.85 
 
 		 266 aa  47.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0977  hypothetical protein  33.96 
 
 		 281 aa  48.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 767 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  28.28 
 
 		 333 aa  48.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  23.98 
 
 		 635 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1049 aa  47  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  22.87 
 
 		 985 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  28.71 
 
 		 267 aa  47  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  29.63 
 
 		 278 aa  46.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  25.15 
 
 		 262 aa  46.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  25.15 
 
 		 262 aa  46.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 264 aa  46.2  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 		 562 aa  45.8  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 287 aa  45.8  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.15 
 
 		 1979 aa  45.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  32.99 
 
 		 255 aa  45.4  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.98 
 
 		 991 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4088  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 1057 aa  45.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.475202  normal  0.216306 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3773  hypothetical protein  23.1 
 
 		 516 aa  45.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3690  hypothetical protein  23.1 
 
 		 516 aa  45.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.594247  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 466 aa  45.1  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 362 aa  44.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3148  tetratricopeptide TPR_2  25.16 
 
 		 659 aa  44.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  hitchhiker  0.000583462 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  28.57 
 
 		 241 aa  44.7  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.25 
 
 		 508 aa  44.7  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>