185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0977 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0977  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  556  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1113  Tol-Pal system YbgF  51.07 
 
 		 272 aa  234  8e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636864  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2363  tetratricopeptide TPR_2  49.44 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.574477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0564  hypothetical protein  48.47 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.85427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0667  hypothetical protein  47.71 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2320  hypothetical protein  47.71 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.152947  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0688  hypothetical protein  39.07 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.17746  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  27.05 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  28.07 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  26.77 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  34.44 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  31.82 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  32.85 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  33.33 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  30.99 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  30.99 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  30.87 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  30.41 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  30.41 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  29.54 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  38.53 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  33.74 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  31.09 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  29.41 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  30.25 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  30.3 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  31.09 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  30.33 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  30.3 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  28.26 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  30.3 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  31.09 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  31.09 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  29.51 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  30.3 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2414  hypothetical protein  27.21 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  30.3 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  30.3 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  30.33 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  29.51 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  29.37 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  29.51 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  25.93 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  25.93 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  28.88 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  28.88 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  28.88 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  28.88 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  28.88 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  28.88 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  28.95 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  27.09 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  27.72 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  31.54 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  25.11 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  25.58 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  27.72 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  27.72 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  27.72 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  27.72 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  27.72 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  24.58 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  32.69 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  30.6 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  30.17 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  30.17 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  30.92 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  25.85 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  25.85 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  29.69 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  30.13 
 
 		 386 aa  58.9  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 269 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  30.09 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  31.5 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  30.89 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  28.93 
 
 		 249 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  32.23 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  30.89 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  31.45 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  34.15 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  29.06 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  27.19 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  33.94 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  29.14 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  28.23 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  24.29 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  26.13 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  24.29 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  29.03 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>