188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2414 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2414  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  30.61 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  27.45 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  28.88 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  27.09 
 
 		 329 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  29.3 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  38.89 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  34.92 
 
 		 488 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  34.92 
 
 		 488 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  31.76 
 
 		 505 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  33.56 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  24.4 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  36.15 
 
 		 386 aa  85.9  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  26.99 
 
 		 321 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  39.09 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  36.57 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  33.12 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  32.68 
 
 		 345 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  26.4 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  32.23 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  33.58 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  33.58 
 
 		 341 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  34.55 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  34.71 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  28.28 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  36.59 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  29.51 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  26.48 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  35.64 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  25.78 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  38.61 
 
 		 236 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  31.71 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  27.27 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 377 aa  68.9  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  27.05 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  30.84 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  25.41 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  30.47 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1113  Tol-Pal system YbgF  35.96 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636864  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  32.29 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  22.18 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  31.01 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0977  hypothetical protein  35.45 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  26.99 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  25.21 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  31.4 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  21.52 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  31.4 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  31.4 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  31.4 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  25.69 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  31.4 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  31.4 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0564  hypothetical protein  31.75 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.85427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  25.66 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  32.73 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  28.27 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  25.63 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  27.42 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0667  hypothetical protein  32.76 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  28.33 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  27.43 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  24.38 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  28.12 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2320  hypothetical protein  32.76 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.152947  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  25 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  25.68 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1597  hypothetical protein  27.95 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.214914 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  26.61 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  27.78 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  28.46 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  25.45 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  29.66 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  29.66 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  28.46 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  32.38 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  25.94 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2363  tetratricopeptide TPR_2  25.71 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.574477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  26.32 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  26.53 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  24.35 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  26.21 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  27.22 
 
 		 335 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  29.06 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>