60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1597 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1597  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  629  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.214914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4507  hypothetical protein  41.51 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0583958  normal  0.160603 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0078  hypothetical protein  45.26 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  30.65 
 
 		 279 aa  92.4  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  29.28 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  28.44 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  29.33 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  22.4 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  24.53 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2414  hypothetical protein  29.49 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  30.23 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  26.46 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  26.69 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  25.99 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  22.9 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 		 386 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0977  hypothetical protein  25.63 
 
 		 281 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  25.97 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  25.15 
 
 		 505 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  23.7 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1113  Tol-Pal system YbgF  32.29 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636864  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  27.12 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  26.28 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  27.12 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  23.83 
 
 		 262 aa  49.3  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  24.62 
 
 		 488 aa  49.3  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  24.62 
 
 		 488 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1209  hypothetical protein  35.63 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  23.64 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  27.08 
 
 		 249 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  27.37 
 
 		 258 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  27.96 
 
 		 258 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  26.25 
 
 		 249 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  25.44 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  25.44 
 
 		 234 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  25.44 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  25.44 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  25.44 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  25.44 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  23.11 
 
 		 263 aa  46.2  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  24.67 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  26.88 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  27.78 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2363  tetratricopeptide TPR_2  25.68 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.574477 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  27.03 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  24.47 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  27.03 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  27.03 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  27.72 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  28.68 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  23.76 
 
 		 267 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0364  hypothetical protein  23 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.947228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  25.26 
 
 		 272 aa  43.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  25.63 
 
 		 239 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>