208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1637 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  99.8 
 
 
488 aa  989    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  100 
 
 
488 aa  993    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  79.37 
 
 
505 aa  732    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  40.38 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  38.03 
 
 
329 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  37.32 
 
 
328 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  38.26 
 
 
345 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  38.3 
 
 
333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  31.54 
 
 
323 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  26.6 
 
 
304 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  36.29 
 
 
279 aa  99.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 
305 aa  98.2  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  33.85 
 
 
348 aa  98.2  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  27.33 
 
 
395 aa  97.8  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  37.23 
 
 
329 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  32.54 
 
 
301 aa  97.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  35.29 
 
 
313 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  26.25 
 
 
339 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  35.03 
 
 
307 aa  94.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  31.43 
 
 
345 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
336 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  31.34 
 
 
321 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  30.6 
 
 
345 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  35.54 
 
 
341 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  25.25 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  29.34 
 
 
386 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2414  hypothetical protein  34.48 
 
 
291 aa  84  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  35.71 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  31.58 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  33.86 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1113  Tol-Pal system YbgF  33.33 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636864  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  28.23 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  27.83 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 
272 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 
266 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
257 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  30.36 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  32.48 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  31.9 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  31.5 
 
 
258 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  32.22 
 
 
269 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  32.22 
 
 
269 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  26.99 
 
 
291 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  32.22 
 
 
269 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  34.02 
 
 
261 aa  64.7  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 
264 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2363  tetratricopeptide TPR_2  34.71 
 
 
283 aa  64.7  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.574477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  28.87 
 
 
254 aa  64.3  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  34.44 
 
 
276 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  29.73 
 
 
258 aa  63.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  28.15 
 
 
263 aa  63.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  31.03 
 
 
263 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 
263 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 
263 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
274 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 
263 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  29.63 
 
 
275 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  31.03 
 
 
263 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  28.44 
 
 
274 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 
263 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 
263 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 
263 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 
263 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  30.43 
 
 
239 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  29.89 
 
 
262 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  32.08 
 
 
241 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0667  hypothetical protein  31.78 
 
 
274 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  29.89 
 
 
262 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  28.7 
 
 
254 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  30.69 
 
 
261 aa  62.4  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  29.89 
 
 
262 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  34.95 
 
 
249 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2320  hypothetical protein  31.78 
 
 
274 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.152947  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0564  hypothetical protein  31.78 
 
 
274 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.85427  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  29.89 
 
 
262 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1209  hypothetical protein  32.54 
 
 
286 aa  61.6  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116621  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  29.89 
 
 
262 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
270 aa  62  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  29.17 
 
 
263 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0977  hypothetical protein  30.33 
 
 
281 aa  60.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268883  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
255 aa  60.5  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  26.05 
 
 
278 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  33.01 
 
 
249 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  29.36 
 
 
236 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  26.61 
 
 
268 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 
271 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 
252 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
240 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  26.61 
 
 
262 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
242 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  25.49 
 
 
304 aa  57.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  26.23 
 
 
273 aa  57.4  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  30.53 
 
 
250 aa  57  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  27.06 
 
 
335 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  31.37 
 
 
274 aa  57  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>