185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3402 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  100 
 
 		 291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3481  hypothetical protein  60.67 
 
 		 281 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3417  hypothetical protein  59.93 
 
 		 281 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60033  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3336  hypothetical protein  59.55 
 
 		 280 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  29.64 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  35.19 
 
 		 239 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  26.69 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  32.2 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  24.77 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  24.77 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  27.39 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  29.68 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  28.11 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  31.63 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  31.63 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  31.63 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  32.65 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  24.49 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  28.93 
 
 		 505 aa  66.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  24.9 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  33.64 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  33.96 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  24.43 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  25.85 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  29.75 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  24.31 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  29.75 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  24.43 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  35.35 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  29.59 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  29.59 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  24.88 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  30.84 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  24.61 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  24.61 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  24.79 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  21.95 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  23.64 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  26.73 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  27.45 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  34 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  31.25 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  34 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  30.84 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  22.73 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  28.12 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  30.19 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  22.87 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  24.34 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  23.64 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  32.04 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  28.57 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  26.47 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  23.18 
 
 		 249 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  34.26 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  23.18 
 
 		 249 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  23.18 
 
 		 249 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  27.13 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  28.83 
 
 		 248 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  23.53 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  23.53 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  23.53 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  23.53 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  23.53 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  27.08 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  23.53 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>