202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4425 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 283 aa  556  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  42.75 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  40.58 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  39.57 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  37.25 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  29.29 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2414  hypothetical protein  36.73 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  34.21 
 
 		 505 aa  92  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  35.71 
 
 		 488 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  35.71 
 
 		 488 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  34.27 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  35.16 
 
 		 321 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  28.38 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  37.27 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  37.19 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  34.38 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  28.82 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  29.15 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  29.15 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  29.15 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  29.15 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  29.15 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  29.15 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  35.88 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  36.36 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  30.2 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  30.05 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  29.95 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  33.59 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  35.45 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  27.27 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  27.69 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  27.18 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  28.93 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  34.25 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  34.35 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 341 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  27.84 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  34.97 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  31.76 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  25.74 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  28.85 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  30.85 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  27.14 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1113  Tol-Pal system YbgF  29.13 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636864  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  27.18 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  27.46 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  27.18 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  33.91 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  26.67 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  26.67 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  26.67 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  26.67 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  27.01 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  29.85 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  27.14 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  29.22 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  27.08 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  29.22 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  24.11 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  27.65 
 
 		 265 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  29.63 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  28.06 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  32.19 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1942  tol-pal system protein YbgF  30.85 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  36.36 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0667  hypothetical protein  34.68 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  26.91 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2320  hypothetical protein  34.68 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.152947  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  24.7 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  24.17 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  25.56 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  26.29 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0564  hypothetical protein  34.15 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.85427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  23.08 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  28.43 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  28.43 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  28.43 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  28.43 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  28.43 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  28.43 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  30.72 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  28.43 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>