30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4507 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4507  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0583958  normal  0.160603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1597  hypothetical protein  42.24 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.214914 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0078  hypothetical protein  42.17 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  27.08 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  27.12 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  26.46 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  25.71 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  23.53 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  23.86 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  41.54 
 
 		 395 aa  53.1  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  23.4 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  28.68 
 
 		 222 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  49.7  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  42.47 
 
 		 386 aa  49.3  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  22.38 
 
 		 328 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  37.23 
 
 		 329 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  25.51 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  22.41 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0977  hypothetical protein  24.76 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  24.3 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  23.39 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  23.08 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  23.61 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  36.21 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  24 
 
 		 271 aa  42.7  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  28.65 
 
 		 348 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  29.54 
 
 		 283 aa  42.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  28.23 
 
 		 488 aa  42.4  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>