35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1225 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1225  hypothetical protein  100 
 
 		 941 aa  1875    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0542  hypothetical protein  42.26 
 
 		 922 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0439  Tetratricopeptide domain protein  40.47 
 
 		 1090 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3076  TPR repeat-containing protein  40.29 
 
 		 1108 aa  581  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3566  coenzyme A biosynthesis protein  33.74 
 
 		 957 aa  518  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1813  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 952 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2960  cellulose binding, type IV  31.57 
 
 		 952 aa  425  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1229  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1016 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.748097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1601  TPR repeat-containing protein  28.59 
 
 		 939 aa  256  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3961  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.08 
 
 		 1058 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357683  normal  0.258592 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.76 
 
 		 1192 aa  93.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215973  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3322  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1193 aa  91.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3466  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1191 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2491  Tetratricopeptide repeat protein  24.02 
 
 		 1155 aa  74.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3386  TPR repeat-containing protein  26.68 
 
 		 1162 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.64 
 
 		 1000 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 878 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 670 aa  53.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  30.73 
 
 		 864 aa  52  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  30.56 
 
 		 249 aa  49.3  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  23.5 
 
 		 725 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.72 
 
 		 810 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.93 
 
 		 248 aa  47  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  22.55 
 
 		 1006 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 1406 aa  46.6  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0543  hypothetical protein  35.71 
 
 		 620 aa  46.2  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.568547  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3712  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 		 304 aa  45.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.4 
 
 		 1077 aa  45.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3603  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.64 
 
 		 304 aa  45.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 927 aa  45.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00490  Pol II transcription elongation factor, putative  37.33 
 
 		 1186 aa  45.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.84309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  28.1 
 
 		 252 aa  44.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  28.47 
 
 		 503 aa  44.3  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.15 
 
 		 938 aa  44.3  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000435275  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  21.71 
 
 		 561 aa  44.3  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>