37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00490 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB00490  Pol II transcription elongation factor, putative  100 
 
 		 1186 aa  2425    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.84309  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11128  RNA polymerase II transcription elongation factor (Ctr9), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G05870)  26.01 
 
 		 1027 aa  248  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0503014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72239  protein required for normal CLN1 and CLN2 G1 cyclin expression  24.42 
 
 		 1120 aa  226  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270618 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42758  predicted protein  23.29 
 
 		 1346 aa  90.9  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.59748  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14940  predicted protein  22.54 
 
 		 1059 aa  87.8  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0306125  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.99 
 
 		 632 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.86 
 
 		 810 aa  55.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 927 aa  53.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  24.6 
 
 		 321 aa  53.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 750 aa  52.8  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 		 878 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 505 aa  51.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 562 aa  50.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  34.48 
 
 		 267 aa  50.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.18 
 
 		 787 aa  50.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.48 
 
 		 3145 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 318 aa  48.9  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 627 aa  48.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 374 aa  47.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  21.17 
 
 		 936 aa  48.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  30.27 
 
 		 1131 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.51 
 
 		 340 aa  47.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 843 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  24.12 
 
 		 985 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.97 
 
 		 795 aa  46.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.5 
 
 		 837 aa  46.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.99 
 
 		 758 aa  45.8  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 201 aa  46.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 		 1288 aa  45.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  28.72 
 
 		 672 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3321  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 453 aa  45.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  20.86 
 
 		 1101 aa  45.4  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  31.73 
 
 		 538 aa  45.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.55 
 
 		 265 aa  45.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 366 aa  44.7  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1550 aa  44.7  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  22.45 
 
 		 1073 aa  44.7  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>