22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0542 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0542  hypothetical protein  100 
 
 		 922 aa  1827    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0439  Tetratricopeptide domain protein  40.67 
 
 		 1090 aa  597  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3076  TPR repeat-containing protein  37.58 
 
 		 1108 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1225  hypothetical protein  42.26 
 
 		 941 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3566  coenzyme A biosynthesis protein  33.02 
 
 		 957 aa  496  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1813  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 952 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2960  cellulose binding, type IV  28.77 
 
 		 952 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1229  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 1016 aa  251  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.748097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1601  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 939 aa  213  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3961  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.9 
 
 		 1058 aa  129  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357683  normal  0.258592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3386  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1162 aa  85.5  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3322  TPR repeat-containing protein  25.04 
 
 		 1193 aa  75.5  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.8 
 
 		 1192 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215973  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3466  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1191 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2491  Tetratricopeptide repeat protein  22.84 
 
 		 1155 aa  62.4  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.83 
 
 		 248 aa  52.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.03 
 
 		 1000 aa  52  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 232 aa  51.2  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3603  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.83 
 
 		 304 aa  48.1  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 573 aa  45.8  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 		 1024 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3712  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.52 
 
 		 304 aa  44.3  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>