More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1256 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 573 aa  1166    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  56.95 
 
 		 333 aa  352  7e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  54.61 
 
 		 334 aa  320  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  53.85 
 
 		 311 aa  317  4e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  52.74 
 
 		 333 aa  310  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  50.34 
 
 		 319 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  50.85 
 
 		 330 aa  285  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  47.46 
 
 		 322 aa  269  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  47.74 
 
 		 315 aa  268  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  48.59 
 
 		 310 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  44.48 
 
 		 316 aa  257  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  43.29 
 
 		 316 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  43.29 
 
 		 316 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  42.95 
 
 		 316 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  42.95 
 
 		 316 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  44.48 
 
 		 326 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  43.54 
 
 		 316 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  45.52 
 
 		 313 aa  249  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  43.2 
 
 		 316 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  43.84 
 
 		 310 aa  247  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  46.34 
 
 		 310 aa  246  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  41.28 
 
 		 316 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  44.98 
 
 		 310 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  43.2 
 
 		 316 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  44.67 
 
 		 305 aa  239  9e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  46.3 
 
 		 314 aa  236  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  43.75 
 
 		 318 aa  233  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  46.46 
 
 		 284 aa  231  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  46.34 
 
 		 310 aa  229  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  44.76 
 
 		 315 aa  228  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  43.56 
 
 		 331 aa  211  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0351  hypothetical protein  41.22 
 
 		 328 aa  203  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0378  hypothetical protein  41.92 
 
 		 328 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0369  hypothetical protein  41.7 
 
 		 328 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  35.99 
 
 		 328 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  34.01 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  32.52 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  43.24 
 
 		 3035 aa  140  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  39.7 
 
 		 3560 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  41.15 
 
 		 4489 aa  139  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  33.66 
 
 		 335 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 		 1827 aa  126  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  31.58 
 
 		 380 aa  126  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  33.09 
 
 		 337 aa  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  30.28 
 
 		 344 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  36.4 
 
 		 1094 aa  117  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  29.74 
 
 		 352 aa  113  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  29.37 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  29.37 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  29.74 
 
 		 340 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  29.37 
 
 		 352 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  29.37 
 
 		 340 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  29.37 
 
 		 340 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  29 
 
 		 340 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  27.83 
 
 		 338 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  30.15 
 
 		 372 aa  110  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  26.82 
 
 		 360 aa  109  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  26.82 
 
 		 360 aa  109  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  27.67 
 
 		 361 aa  107  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  48.65 
 
 		 1276 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  28.32 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  29.37 
 
 		 340 aa  104  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  28.25 
 
 		 337 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.14 
 
 		 764 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  36.32 
 
 		 1694 aa  103  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  29 
 
 		 352 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 543 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 713 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  26.22 
 
 		 360 aa  102  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  37.43 
 
 		 377 aa  102  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  27.78 
 
 		 355 aa  101  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  26.45 
 
 		 354 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  31.88 
 
 		 352 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  27.97 
 
 		 324 aa  97.8  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  27.55 
 
 		 357 aa  97.4  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  29.78 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  27.18 
 
 		 329 aa  95.5  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 740 aa  95.5  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 833 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  27.36 
 
 		 341 aa  94.7  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  37.87 
 
 		 341 aa  94.4  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.77 
 
 		 560 aa  93.6  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.12 
 
 		 739 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  28.14 
 
 		 357 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34 
 
 		 742 aa  93.6  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  27.55 
 
 		 349 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  92.8  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  34.76 
 
 		 1007 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  27.38 
 
 		 348 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.27 
 
 		 622 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  27.85 
 
 		 343 aa  92.4  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  28.08 
 
 		 390 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>