241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2818 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  638    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  77.78 
 
 		 310 aa  431  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  69.51 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  56.62 
 
 		 310 aa  338  8e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  59.11 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  49.03 
 
 		 333 aa  272  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  47.46 
 
 		 573 aa  268  7e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  48.77 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  46.89 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  46.4 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  45.05 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  42.96 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  41.67 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  44.44 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  43.92 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  44.44 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  44.24 
 
 		 284 aa  226  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  44.52 
 
 		 310 aa  225  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  43.67 
 
 		 316 aa  226  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0351  hypothetical protein  47.47 
 
 		 328 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  42.81 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  44.64 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  44.1 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  44.1 
 
 		 316 aa  222  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  43.55 
 
 		 316 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  43.55 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  43.55 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  43.24 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  43.55 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  44.29 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  45.76 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  43.84 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0369  hypothetical protein  47.69 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0378  hypothetical protein  47.88 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  36.42 
 
 		 335 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  39.26 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  36.91 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  34 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  35.13 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  33.7 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  37.85 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  35.42 
 
 		 380 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  32.28 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  30.74 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  29.73 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  33.73 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  33.73 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  33.33 
 
 		 352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  37.02 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  31.83 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  32.1 
 
 		 347 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  33.73 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  33.65 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  32.94 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  30.63 
 
 		 356 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  29.33 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  32.5 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  28.09 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  26.9 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  27.06 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  31.71 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  34.48 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  28.47 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  34.48 
 
 		 336 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  26.42 
 
 		 360 aa  99.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  26.42 
 
 		 360 aa  99.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  29.32 
 
 		 340 aa  99.4  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  29.15 
 
 		 355 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  27.83 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  29.29 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  28.57 
 
 		 352 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  26.72 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  32.39 
 
 		 350 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  27.83 
 
 		 359 aa  96.7  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  29.49 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  28.06 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  27.4 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  31.62 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  30.87 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  28.67 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  31.71 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  25.32 
 
 		 348 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  30.45 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  27.87 
 
 		 357 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  30.04 
 
 		 361 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  30.04 
 
 		 361 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  24.19 
 
 		 354 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  32.43 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4549  hypothetical protein  31.56 
 
 		 373 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1780  hypothetical protein  28.23 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0136409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2130  hypothetical protein  32.21 
 
 		 374 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000290153  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  25.72 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  27.48 
 
 		 368 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  29.41 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  29.17 
 
 		 343 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  29.41 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  28.99 
 
 		 356 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  28.99 
 
 		 356 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>