249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3719 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  671    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  85.42 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  76.52 
 
 		 362 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  68.71 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  71.11 
 
 		 356 aa  381  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  68.89 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  64.93 
 
 		 365 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4549  hypothetical protein  63.22 
 
 		 373 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  58.16 
 
 		 336 aa  322  9.000000000000001e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  57.86 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  58.44 
 
 		 312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  50.9 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1346  hypothetical protein  45.65 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.483374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0950  hypothetical protein  55.36 
 
 		 353 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  52.19 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  51.54 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  33.53 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  32.81 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  33.12 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  32.81 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  32.49 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  32.7 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  32.49 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  32.49 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  32.06 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  33.73 
 
 		 348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  31.82 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  33.12 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  32.7 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  32.46 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  32.46 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  33.77 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  33.72 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  33.1 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  35.25 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  30.12 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  32.64 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  29.41 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  29.77 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  30.82 
 
 		 346 aa  129  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1827  conserved hypothetical protein 698  33.83 
 
 		 346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.811331  normal  0.978581 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  31.36 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  28.37 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  35.12 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  32.53 
 
 		 380 aa  123  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  30.63 
 
 		 335 aa  122  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  31.54 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1009  hypothetical protein  36.97 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1641  hypothetical protein  36.97 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4276  hypothetical protein  36.97 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.745778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  27.36 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  29.94 
 
 		 345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  36.9 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  34.71 
 
 		 372 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  27.65 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4010  hypothetical protein  36.64 
 
 		 339 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  30.53 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  31.6 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  28.84 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  28.81 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  26.51 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  28.22 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  30.38 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  28.14 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  36.96 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  33.83 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  27.68 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  28.17 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  28.17 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  28.17 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  29.45 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  28.17 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  28.17 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  27.4 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6400  membrane protein-like protein  30.08 
 
 		 472 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  29.63 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  31.89 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  27.34 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3353  hypothetical protein  31.79 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  31 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  30.95 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  30.46 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  30.49 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  27.46 
 
 		 357 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  30.07 
 
 		 361 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  32.25 
 
 		 331 aa  99.4  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0127  hypothetical protein  28.57 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2283  hypothetical protein  30.63 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533884 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8353  hypothetical protein  30.13 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  29.52 
 
 		 390 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  27.41 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3881  hypothetical protein  35.34 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  31.37 
 
 		 351 aa  96.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  28.83 
 
 		 331 aa  97.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  28.83 
 
 		 331 aa  97.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  26.64 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  26.64 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  26.64 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  26.64 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>