245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4549 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4549  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  676    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  75.42 
 
 		 365 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  62.23 
 
 		 356 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  62.7 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  63.98 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  62.25 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  63.91 
 
 		 312 aa  346  4e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  64.29 
 
 		 350 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  69.04 
 
 		 348 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  61.77 
 
 		 356 aa  329  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  59.16 
 
 		 360 aa  319  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  53.33 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1346  hypothetical protein  49.54 
 
 		 346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.483374 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  54.49 
 
 		 341 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0950  hypothetical protein  60.58 
 
 		 353 aa  269  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  49.03 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  37.38 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  37.05 
 
 		 340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  36.39 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  36.72 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  36.39 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  36.39 
 
 		 340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  36.07 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  36.07 
 
 		 352 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  37.05 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  36.26 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  36.72 
 
 		 340 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  35.74 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  34.45 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  34.29 
 
 		 355 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  34.99 
 
 		 360 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  34.99 
 
 		 360 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  35.6 
 
 		 352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  34.9 
 
 		 354 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  30.18 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  28.76 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  34.58 
 
 		 339 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  33.14 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  31.01 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  29.69 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  34.4 
 
 		 324 aa  133  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  33.43 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  32.53 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  31.8 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  31.72 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1827  conserved hypothetical protein 698  33.24 
 
 		 346 aa  124  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.811331  normal  0.978581 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  30.46 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  29.56 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  31.96 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  29.58 
 
 		 341 aa  116  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  30.87 
 
 		 411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  32.24 
 
 		 326 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  30.03 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  27.7 
 
 		 325 aa  113  7.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  28.85 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  36.36 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  28.73 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  28.52 
 
 		 348 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  34.78 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  29.34 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  29.34 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  29.34 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  29.34 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  29.34 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  37.81 
 
 		 361 aa  110  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  32.23 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  36.13 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  31.58 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  30.93 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  30.77 
 
 		 340 aa  107  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  31.56 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0127  hypothetical protein  26.91 
 
 		 339 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  36.5 
 
 		 372 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  31.23 
 
 		 369 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  28.29 
 
 		 328 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  35.4 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  35.27 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  35.4 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  30.67 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  32.75 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  26.78 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  26.78 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  25.85 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  29.55 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  26.78 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  26.78 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  26.78 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  26.78 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  26.78 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  26.78 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  32.75 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  32.75 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  30.23 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  32.11 
 
 		 319 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  26.91 
 
 		 348 aa  103  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  28.83 
 
 		 362 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  28.83 
 
 		 362 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  29.63 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  28.83 
 
 		 362 aa  102  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>