248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0806 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  653    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1827  conserved hypothetical protein 698  64.15 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.811331  normal  0.978581 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  59.32 
 
 		 345 aa  348  7e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0153  hypothetical protein  62.26 
 
 		 345 aa  341  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4010  hypothetical protein  63.98 
 
 		 339 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1009  hypothetical protein  63.35 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1641  hypothetical protein  63.35 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4276  hypothetical protein  63.35 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.745778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3353  hypothetical protein  54.72 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  49.84 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  50.61 
 
 		 342 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1861  hypothetical protein  50 
 
 		 372 aa  294  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00940925  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0042  hypothetical protein  50.62 
 
 		 372 aa  289  6e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  49.68 
 
 		 369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  47.04 
 
 		 340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8353  hypothetical protein  49.7 
 
 		 346 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2170  hypothetical protein  51.75 
 
 		 364 aa  268  8.999999999999999e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  49.08 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  48.11 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3144  hypothetical protein  52.61 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3881  hypothetical protein  52.61 
 
 		 332 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4024  hypothetical protein  47.35 
 
 		 346 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.819809 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2894  hypothetical protein  41.21 
 
 		 351 aa  186  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.380693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  35.82 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2706  hypothetical protein  39.31 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1667  hypothetical protein  37.79 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  35.2 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2449  hypothetical protein  35.76 
 
 		 359 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  32.53 
 
 		 354 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  32.34 
 
 		 348 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  33.91 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  33.91 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  31.94 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  32.37 
 
 		 338 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  28.57 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  35.17 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  35.23 
 
 		 324 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  31.82 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  32.83 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  35.47 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  35.76 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  36.72 
 
 		 356 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  37.16 
 
 		 353 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2283  hypothetical protein  32.18 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  36.76 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  29.46 
 
 		 368 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  36.93 
 
 		 365 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  38.41 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  34.81 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  36.15 
 
 		 358 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  35.36 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  38.41 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  32.48 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  37 
 
 		 361 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  34.44 
 
 		 361 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  34.44 
 
 		 361 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  33.81 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  36.59 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  30 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  29.34 
 
 		 326 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  28.7 
 
 		 357 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2241  hypothetical protein  34.46 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  30.25 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2068  hypothetical protein  38.77 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  29.1 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  29.43 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  30.45 
 
 		 355 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  35.38 
 
 		 355 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  30.9 
 
 		 360 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  31.49 
 
 		 355 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  35.74 
 
 		 351 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  30.9 
 
 		 360 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  29.77 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  31.14 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  29.06 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  30.23 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  29.1 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  30.23 
 
 		 340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  29.43 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  29.47 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  29.77 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  33.93 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  33.99 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  26.67 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  32.28 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  34.02 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  29.43 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  34.59 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  33.93 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  34.23 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  33.93 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  27.1 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  37.05 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  30.82 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  32.35 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  28.8 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  30.23 
 
 		 349 aa  105  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  30.23 
 
 		 349 aa  105  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  30.23 
 
 		 349 aa  105  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>