234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3881 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3881  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3144  hypothetical protein  99.4 
 
 		 332 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  53.7 
 
 		 369 aa  302  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1861  hypothetical protein  53.29 
 
 		 372 aa  288  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00940925  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1827  conserved hypothetical protein 698  51.27 
 
 		 346 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.811331  normal  0.978581 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  51.56 
 
 		 342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  53.16 
 
 		 345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0042  hypothetical protein  52.5 
 
 		 372 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  50.5 
 
 		 331 aa  269  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8353  hypothetical protein  51.08 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2170  hypothetical protein  54.66 
 
 		 364 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  53.14 
 
 		 343 aa  255  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  50.16 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4010  hypothetical protein  52.87 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115969  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  48.25 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3353  hypothetical protein  50.32 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0153  hypothetical protein  46.91 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  47.02 
 
 		 348 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1009  hypothetical protein  50.32 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1641  hypothetical protein  50.32 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4276  hypothetical protein  50.32 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.745778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4024  hypothetical protein  45.22 
 
 		 346 aa  196  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.819809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2706  hypothetical protein  43.09 
 
 		 351 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2894  hypothetical protein  39.94 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.380693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  36.36 
 
 		 355 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  35.76 
 
 		 348 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2449  hypothetical protein  39.45 
 
 		 359 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  34.89 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1667  hypothetical protein  40.74 
 
 		 366 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  34.44 
 
 		 354 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  33.53 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  32.82 
 
 		 355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  34.34 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  34.34 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  35.23 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  34.34 
 
 		 352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  32.43 
 
 		 340 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  32.42 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  31.74 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  32.08 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  31.4 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  31.74 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  32.44 
 
 		 368 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  32.62 
 
 		 357 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  32.61 
 
 		 340 aa  129  6e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  32.08 
 
 		 352 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  31.4 
 
 		 340 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  32.06 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  31.75 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  35.17 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  31.56 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  36.93 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  30.72 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  31.4 
 
 		 337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  30.72 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  35.31 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2283  hypothetical protein  34.88 
 
 		 362 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  32.02 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  34.93 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  34.9 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  30.97 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  30.97 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  30.97 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  30.97 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  31.06 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  30.97 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  32.42 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  31.38 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  31.38 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  31.38 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  31.38 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  34.74 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  31.38 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  31.38 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  31.38 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  31.38 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  30.41 
 
 		 362 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  32.09 
 
 		 361 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  32.09 
 
 		 361 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  32.45 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  34.46 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  31.75 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  35.78 
 
 		 356 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  34.33 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  35.8 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  35.94 
 
 		 350 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  33.89 
 
 		 362 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  30.84 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  27.18 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  34.03 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  30.95 
 
 		 361 aa  109  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  33.45 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  33.45 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  29.59 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  33.33 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  28.62 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  32.95 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  32.37 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  32.09 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>