249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1641 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1009  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  636    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1641  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  636    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4276  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  636    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.745778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4010  hypothetical protein  82.2 
 
 		 339 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1827  conserved hypothetical protein 698  65.85 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.811331  normal  0.978581 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  63.04 
 
 		 345 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0153  hypothetical protein  65.83 
 
 		 345 aa  348  6e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  64.74 
 
 		 343 aa  346  3e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3353  hypothetical protein  53.82 
 
 		 341 aa  297  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0042  hypothetical protein  51.57 
 
 		 372 aa  292  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8353  hypothetical protein  52.65 
 
 		 346 aa  289  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  49.05 
 
 		 331 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  50.94 
 
 		 342 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1861  hypothetical protein  50.78 
 
 		 372 aa  281  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00940925  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2170  hypothetical protein  53.54 
 
 		 364 aa  275  8e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  47.62 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  45.17 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  47.15 
 
 		 340 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  47.35 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4024  hypothetical protein  47.95 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.819809 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3881  hypothetical protein  50.68 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3144  hypothetical protein  50.68 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2894  hypothetical protein  40.88 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.380693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  37.42 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2706  hypothetical protein  40.99 
 
 		 351 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  35.17 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  35.17 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1667  hypothetical protein  38.78 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2449  hypothetical protein  36.76 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  35.15 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  37.11 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  34.69 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  33.02 
 
 		 355 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  34.62 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  32.99 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  34.78 
 
 		 356 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  38.71 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  36.33 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  27.97 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  35.9 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  29.48 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  33.23 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  35.9 
 
 		 343 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  35.53 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  36.5 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  36.36 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  32.01 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  31.19 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  36.76 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  28 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  35.61 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  35.93 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  27.69 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  34.62 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  32.21 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  29.89 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  35.76 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  35.76 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  36.18 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  34.78 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  27.69 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  34.78 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  27.69 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  34.78 
 
 		 346 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  27.38 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  37.4 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  27.38 
 
 		 352 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  35.09 
 
 		 343 aa  115  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  32.33 
 
 		 362 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  35.52 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  33.96 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  32.84 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  36.54 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  36.77 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  27.08 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  32.98 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  32.98 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  31.91 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  32.98 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  32.98 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  33.11 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  32.98 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  32.98 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  32.98 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  32.98 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  32.98 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  26.83 
 
 		 340 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  31.76 
 
 		 348 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  35.4 
 
 		 355 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  31.08 
 
 		 359 aa  112  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  31.54 
 
 		 349 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  31.54 
 
 		 349 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  31.54 
 
 		 349 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  31.54 
 
 		 349 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  31.54 
 
 		 349 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  32.58 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  33.02 
 
 		 361 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  29.91 
 
 		 355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  35.86 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  35.86 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>