246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2972 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  50.9 
 
 
356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  52.07 
 
 
362 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  53.8 
 
 
341 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  51.2 
 
 
346 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  49 
 
 
365 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  50.94 
 
 
356 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  48.8 
 
 
336 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4549  hypothetical protein  54.27 
 
 
373 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  51.16 
 
 
312 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  53 
 
 
348 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  51.45 
 
 
360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  49.21 
 
 
350 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1346  hypothetical protein  45.31 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.483374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  45.7 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0950  hypothetical protein  47.85 
 
 
353 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  34.46 
 
 
355 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  35.02 
 
 
337 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  35.35 
 
 
340 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  35.81 
 
 
360 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  35.02 
 
 
352 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  35.81 
 
 
360 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  35.02 
 
 
340 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  34.34 
 
 
352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  35.35 
 
 
340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  34.68 
 
 
340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  34.68 
 
 
352 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  34.34 
 
 
340 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  31.93 
 
 
355 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  35.35 
 
 
352 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  30.55 
 
 
338 aa  138  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  35.02 
 
 
340 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  34.69 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  34.64 
 
 
347 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  30.35 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  33.13 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  33.09 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  33.22 
 
 
348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  31.53 
 
 
348 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  32.87 
 
 
357 aa  125  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  30.89 
 
 
355 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  29.29 
 
 
368 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  31 
 
 
349 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  31 
 
 
349 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  31 
 
 
349 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  31 
 
 
349 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  31 
 
 
349 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  31.55 
 
 
362 aa  122  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  31.55 
 
 
362 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  31.55 
 
 
362 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  34.14 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  34.8 
 
 
341 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  27.94 
 
 
362 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  29.31 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  29.31 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  29.31 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  31.39 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  29.31 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  29.31 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  29.31 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  29.31 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  29.31 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  29 
 
 
349 aa  116  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  32.56 
 
 
340 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  34.48 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  32.17 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  29.21 
 
 
340 aa  114  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  27.49 
 
 
341 aa  113  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  31.63 
 
 
359 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  30.07 
 
 
335 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  32.7 
 
 
351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  30.33 
 
 
361 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  26.53 
 
 
377 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  32.89 
 
 
359 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  29.47 
 
 
325 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  27.25 
 
 
346 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  28.38 
 
 
340 aa  107  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  33.21 
 
 
345 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  30.93 
 
 
329 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  30.6 
 
 
360 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  30.6 
 
 
360 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0127  hypothetical protein  30.43 
 
 
339 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  27.71 
 
 
331 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  32.5 
 
 
322 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  28.73 
 
 
326 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  29.97 
 
 
361 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  28.21 
 
 
343 aa  103  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  29.37 
 
 
360 aa  102  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  29.89 
 
 
328 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1009  hypothetical protein  33.2 
 
 
338 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1641  hypothetical protein  33.2 
 
 
338 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4276  hypothetical protein  33.2 
 
 
338 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.745778  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  32.05 
 
 
338 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  28.42 
 
 
335 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  27.36 
 
 
331 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  27.36 
 
 
331 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  29.75 
 
 
369 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  29.74 
 
 
361 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  29.74 
 
 
361 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2130  hypothetical protein  33.1 
 
 
374 aa  99.4  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000290153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>