248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0419 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  682    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  43.4 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  39.51 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0127  hypothetical protein  41.99 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2057  hypothetical protein  44.72 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  28.96 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  30 
 
 		 356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  32.63 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  31.48 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  27.05 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  27.94 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  27.94 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  27.94 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  27.94 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  27.94 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  31.44 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  29.75 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  29.05 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  26.27 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  25.96 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  27.96 
 
 		 357 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  30.27 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  32.18 
 
 		 326 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1346  hypothetical protein  28.4 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.483374 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  30.94 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  29.37 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  32.7 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  28.27 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  26.38 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  28.36 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  27.02 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  26.65 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  26.63 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  25.91 
 
 		 360 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  29.66 
 
 		 350 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  25.91 
 
 		 360 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  26.42 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  26.3 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  26.35 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  29.72 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  29.17 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  29.89 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  27.86 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  28.29 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  28 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  26.4 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  26.42 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  27.86 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  27.22 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  27.3 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  29.53 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  26.76 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  29.53 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  29.53 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  30.14 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  26.76 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  31.06 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  31.76 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  26.19 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  26.19 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1827  conserved hypothetical protein 698  29.77 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.811331  normal  0.978581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  26.98 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  26.83 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  32.14 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  29.06 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4010  hypothetical protein  29.92 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115969  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  26.79 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  26.33 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  26.46 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  25.17 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  28.83 
 
 		 353 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  27.56 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  25.69 
 
 		 411 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  30.94 
 
 		 340 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  29.93 
 
 		 352 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  30.5 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  29.93 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2241  hypothetical protein  27.72 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  28.82 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  29.61 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  27.21 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  29.21 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  28.38 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  27.72 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  29.93 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  29.61 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  27.21 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  27.21 
 
 		 356 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  29.61 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  28.01 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  26.25 
 
 		 357 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  28.83 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2068  hypothetical protein  29.18 
 
 		 353 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>