239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1346 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1346  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  661    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.483374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  45.65 
 
 
356 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  44.44 
 
 
362 aa  252  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  49.52 
 
 
336 aa  247  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  48.77 
 
 
346 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  47.65 
 
 
365 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  47.59 
 
 
350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  48.43 
 
 
348 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  49.33 
 
 
312 aa  236  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  46.06 
 
 
360 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  46.71 
 
 
356 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  45.31 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4549  hypothetical protein  49.07 
 
 
373 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  45.63 
 
 
341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0950  hypothetical protein  48.77 
 
 
353 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  45.58 
 
 
304 aa  198  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  32.53 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  28.34 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  32.27 
 
 
340 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  32.53 
 
 
352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  31.72 
 
 
340 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  31.72 
 
 
340 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  32.18 
 
 
352 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  32.18 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  31.42 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  33.56 
 
 
352 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  32.72 
 
 
348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  31.88 
 
 
354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  29.17 
 
 
337 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  32.53 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  30.38 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  32.02 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  32.57 
 
 
355 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  30.46 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  30.46 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  32.52 
 
 
328 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  28.92 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  28.93 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  26.91 
 
 
377 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  29.79 
 
 
337 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  29.06 
 
 
362 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  28.44 
 
 
331 aa  108  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  30.42 
 
 
339 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  30.71 
 
 
338 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  28.01 
 
 
331 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  28.01 
 
 
331 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  30.07 
 
 
324 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  28.73 
 
 
340 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  30.86 
 
 
346 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  30.86 
 
 
361 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  30.86 
 
 
361 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  27.65 
 
 
326 aa  99.4  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  27.75 
 
 
349 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  27.75 
 
 
349 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  27.75 
 
 
349 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  27.75 
 
 
349 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  27.75 
 
 
349 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  27.75 
 
 
349 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  27.75 
 
 
349 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  27.75 
 
 
349 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  27.72 
 
 
363 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  28.27 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  30.71 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  28.27 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  28.27 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  27.43 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  29.58 
 
 
355 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  28.27 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  26.48 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  27.46 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0111  hypothetical protein  28.04 
 
 
331 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  27.47 
 
 
335 aa  96.7  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  31.08 
 
 
355 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  27.92 
 
 
343 aa  96.3  8e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  27.14 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  26.43 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  32.62 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1827  conserved hypothetical protein 698  29.94 
 
 
346 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.811331  normal  0.978581 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  28.21 
 
 
345 aa  92.8  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  26.87 
 
 
411 aa  92  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  30.63 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  30.26 
 
 
358 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  32.6 
 
 
372 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  30.22 
 
 
343 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  28.57 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  30.35 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  28.14 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  30 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  30 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  30 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  30.98 
 
 
390 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  29.17 
 
 
368 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  29.82 
 
 
361 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  30.92 
 
 
336 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0127  hypothetical protein  27.07 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  30.43 
 
 
359 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  33.6 
 
 
347 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  37.11 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  25.78 
 
 
340 aa  87  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09940  predicted membrane protein  31.91 
 
 
441 aa  86.3  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.903662  normal  0.219021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>