251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5153 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  52.37 
 
 
339 aa  296  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  54.27 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  53.92 
 
 
346 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  53.76 
 
 
365 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  51.59 
 
 
356 aa  279  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  52.79 
 
 
362 aa  275  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  54.81 
 
 
312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  53.85 
 
 
348 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  52.27 
 
 
360 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  50.46 
 
 
350 aa  250  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4549  hypothetical protein  54.49 
 
 
373 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  53.82 
 
 
304 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  50.32 
 
 
356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1346  hypothetical protein  45.2 
 
 
346 aa  231  9e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.483374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0950  hypothetical protein  48.85 
 
 
353 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  35.62 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  37.5 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  35.62 
 
 
340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  35.27 
 
 
340 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  35.27 
 
 
352 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  35.27 
 
 
340 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  34.59 
 
 
340 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  34.93 
 
 
352 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  34.59 
 
 
340 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  35.27 
 
 
352 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  35.27 
 
 
340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  35.14 
 
 
355 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  34.94 
 
 
360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  34.94 
 
 
360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  38.32 
 
 
352 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  34.84 
 
 
335 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  35.15 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  35.41 
 
 
324 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  34.64 
 
 
354 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  33.97 
 
 
348 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  31.8 
 
 
355 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  29.56 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  36.5 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  30.6 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  30.55 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  30.18 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  31.86 
 
 
335 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  29.43 
 
 
340 aa  126  6e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  28.57 
 
 
377 aa  126  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  33.93 
 
 
380 aa  123  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  30.66 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  32.13 
 
 
345 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  32.5 
 
 
340 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  34.46 
 
 
351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  31.67 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  29.08 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  30.58 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  31.14 
 
 
328 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  29.7 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  32.38 
 
 
346 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  32.14 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  30.26 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  32.14 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  29.69 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  31.85 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  31.25 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  28.07 
 
 
341 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  29.32 
 
 
362 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  29.76 
 
 
355 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  32.37 
 
 
372 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  37.35 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  32.39 
 
 
358 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  30.86 
 
 
362 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  30.86 
 
 
362 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  30.86 
 
 
362 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  28.83 
 
 
340 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  33.7 
 
 
343 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  28.95 
 
 
331 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  28.95 
 
 
331 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  30.34 
 
 
361 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0111  hypothetical protein  25.74 
 
 
331 aa  105  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  33.22 
 
 
360 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  33.22 
 
 
360 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2283  hypothetical protein  30.97 
 
 
362 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  27.92 
 
 
348 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  33.6 
 
 
361 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  28.29 
 
 
349 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  33.7 
 
 
343 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  29.81 
 
 
344 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  31.74 
 
 
329 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  27.96 
 
 
349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  27.96 
 
 
349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  27.96 
 
 
349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  27.96 
 
 
349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  34.77 
 
 
369 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  28.06 
 
 
325 aa  100  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  31.71 
 
 
342 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  26.65 
 
 
349 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  28.7 
 
 
368 aa  99.4  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  33 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  33.86 
 
 
336 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  29.33 
 
 
390 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  28.08 
 
 
352 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  27.05 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>