254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0629 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  649    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  46.37 
 
 
328 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  43.92 
 
 
337 aa  278  8e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  47.79 
 
 
335 aa  260  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  43.59 
 
 
380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  43.11 
 
 
341 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  43.12 
 
 
335 aa  238  9e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  42.98 
 
 
344 aa  224  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  39.74 
 
 
372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1780  hypothetical protein  38.75 
 
 
344 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0136409  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  34.48 
 
 
354 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  32.58 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  33.89 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  33.89 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  36 
 
 
310 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  32.65 
 
 
355 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  34.52 
 
 
377 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  30.43 
 
 
355 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  33.81 
 
 
352 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  36.42 
 
 
322 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  31.25 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  38.31 
 
 
310 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  32.21 
 
 
324 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  32.33 
 
 
352 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  32.33 
 
 
340 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  32.02 
 
 
352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  34.35 
 
 
319 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  32.02 
 
 
340 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  32.02 
 
 
340 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  34.34 
 
 
326 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 
573 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  31.42 
 
 
352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  31.72 
 
 
340 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  31.56 
 
 
334 aa  152  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  34.29 
 
 
330 aa  151  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  30.82 
 
 
340 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  31.17 
 
 
357 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  31.25 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  35.93 
 
 
333 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  37.04 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  35.52 
 
 
310 aa  146  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  33.67 
 
 
311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  36.09 
 
 
310 aa  145  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  31.12 
 
 
352 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  35.14 
 
 
318 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  31.33 
 
 
340 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  34.22 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  31.63 
 
 
352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  32.64 
 
 
390 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  35.71 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  33.89 
 
 
316 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  36.53 
 
 
316 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  30.94 
 
 
338 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  36.53 
 
 
316 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  33.22 
 
 
316 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  36.53 
 
 
316 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  36.53 
 
 
316 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  30.27 
 
 
348 aa  136  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  30.56 
 
 
349 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  30.56 
 
 
349 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 
349 aa  136  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  30.56 
 
 
349 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  30.56 
 
 
349 aa  136  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  30.56 
 
 
349 aa  136  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  30.56 
 
 
349 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  30.56 
 
 
349 aa  136  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  30.56 
 
 
349 aa  136  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  30.38 
 
 
349 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  31.75 
 
 
284 aa  135  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  30.06 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  30.06 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  35.21 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  30.06 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  30.85 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  30.06 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  32.06 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  31.91 
 
 
362 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  33.58 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  29.52 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0351  hypothetical protein  31.82 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  33.21 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  30.03 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  29.77 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  34.23 
 
 
331 aa  129  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  33.44 
 
 
348 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  33.59 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  29.39 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  27.7 
 
 
359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  31.06 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  29.32 
 
 
340 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0369  hypothetical protein  31.92 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  40.34 
 
 
314 aa  126  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  33.11 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  30.21 
 
 
340 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  30.06 
 
 
368 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0378  hypothetical protein  31.54 
 
 
328 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  32.98 
 
 
315 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  30.93 
 
 
351 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  30.06 
 
 
338 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  31.14 
 
 
411 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>