228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0378 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0378  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0351  hypothetical protein  94.51 
 
 
328 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0369  hypothetical protein  94.82 
 
 
328 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  47.35 
 
 
310 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  48.15 
 
 
322 aa  239  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  46.67 
 
 
310 aa  235  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  43.96 
 
 
333 aa  232  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  47.02 
 
 
319 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  48.15 
 
 
310 aa  225  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  41.94 
 
 
311 aa  223  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  47.65 
 
 
310 aa  222  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  49.08 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  42.27 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  40.07 
 
 
573 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  46.52 
 
 
334 aa  218  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  43.99 
 
 
330 aa  212  7.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  39.88 
 
 
326 aa  205  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  43.3 
 
 
284 aa  205  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  42.18 
 
 
305 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  40.06 
 
 
316 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  39.8 
 
 
315 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  40.06 
 
 
316 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  39.75 
 
 
316 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  39.75 
 
 
316 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  39.62 
 
 
310 aa  202  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  40.14 
 
 
313 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  41.33 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  40.98 
 
 
316 aa  199  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  41 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  41 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  40.33 
 
 
316 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  40.07 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  43.53 
 
 
318 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  38.06 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  35.85 
 
 
328 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  33.33 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  30.72 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  39.64 
 
 
372 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  35.5 
 
 
380 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  31.85 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  31.85 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  34.11 
 
 
344 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  29.26 
 
 
335 aa  116  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  34.48 
 
 
339 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  33.58 
 
 
355 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  34.13 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  31.79 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  31.84 
 
 
348 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  34.87 
 
 
352 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  28.47 
 
 
354 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  27.21 
 
 
335 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  27.67 
 
 
340 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  28.09 
 
 
363 aa  99  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  35.79 
 
 
362 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  35.66 
 
 
356 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  24.66 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  35.59 
 
 
351 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  28.75 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  31.2 
 
 
390 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  29.46 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  35.66 
 
 
348 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  33.05 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  33.05 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  33.05 
 
 
346 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  29.25 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  25.9 
 
 
352 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  28.01 
 
 
361 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  32.47 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  26.58 
 
 
346 aa  87.8  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  28.3 
 
 
357 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  25.9 
 
 
352 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  32.62 
 
 
343 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  25.9 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  32.19 
 
 
358 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  28 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  25.54 
 
 
352 aa  85.9  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  32.54 
 
 
343 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  27.92 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  26.26 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  36.97 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  25.54 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  25.58 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  28.44 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  34.72 
 
 
356 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  39.42 
 
 
341 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  31.16 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  31.02 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  34.26 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  27.72 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  31.79 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  27.59 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  34.26 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1780  hypothetical protein  25.88 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0136409  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  24.24 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  37.14 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  29.83 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  31.11 
 
 
365 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  27.69 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  29.12 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  31.67 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.735996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>