229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0104 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  599  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  84.11 
 
 		 314 aa  484  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  73.46 
 
 		 326 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  72.96 
 
 		 316 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  72.96 
 
 		 316 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  73.29 
 
 		 316 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  73.29 
 
 		 316 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  73.93 
 
 		 316 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  74.67 
 
 		 316 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  73.93 
 
 		 316 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  74.26 
 
 		 316 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  74.59 
 
 		 316 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  71.48 
 
 		 318 aa  408  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  69.13 
 
 		 315 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  63.19 
 
 		 315 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  59.22 
 
 		 313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  60.14 
 
 		 305 aa  342  7e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  59.01 
 
 		 284 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  51.34 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  50 
 
 		 333 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  48.41 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  43.84 
 
 		 573 aa  247  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  51.56 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  46.9 
 
 		 310 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  46.05 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  44.52 
 
 		 322 aa  225  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  44.33 
 
 		 319 aa  225  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  44.37 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  43.85 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  43.64 
 
 		 310 aa  195  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  45.35 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0351  hypothetical protein  40.26 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  39.92 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0369  hypothetical protein  40.33 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0378  hypothetical protein  42.63 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  36.84 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  36.09 
 
 		 335 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  34 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  33.12 
 
 		 380 aa  129  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  32.82 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  34.7 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  29.45 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  31.65 
 
 		 372 aa  112  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  27.84 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  32.41 
 
 		 352 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  32.41 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  32.02 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  32.02 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  29.1 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  31.76 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  32.41 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  31.62 
 
 		 352 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  31.76 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  30.13 
 
 		 355 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  27.27 
 
 		 360 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  27.27 
 
 		 360 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  31.41 
 
 		 334 aa  99  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  32.55 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  28.9 
 
 		 355 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  32.02 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  28.25 
 
 		 361 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  33.58 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  30.65 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  46.67 
 
 		 377 aa  92.8  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  92.4  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  28.24 
 
 		 340 aa  90.5  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  28.45 
 
 		 355 aa  90.5  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  28.57 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  28.57 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  28.57 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  28.57 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  28.57 
 
 		 349 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  29.81 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  30.3 
 
 		 329 aa  89  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  28.62 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  28.62 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  28.62 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  28.62 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  28.62 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  28.62 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  24.9 
 
 		 354 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  28.62 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  28.62 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  28.62 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  26.39 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  28.41 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  27.27 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  27.27 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  32.74 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  32.13 
 
 		 361 aa  86.7  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  27.78 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  25.84 
 
 		 348 aa  86.7  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  27.78 
 
 		 361 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  27.78 
 
 		 361 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  28.68 
 
 		 360 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  27.44 
 
 		 357 aa  85.9  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  28.31 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  27.31 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  27.31 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  27.82 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>