234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4708 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  626  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  93.67 
 
 		 316 aa  594  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  93.04 
 
 		 316 aa  590  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  93.67 
 
 		 316 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  86.71 
 
 		 316 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  86.71 
 
 		 316 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  86.71 
 
 		 316 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  86.39 
 
 		 316 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  86.39 
 
 		 316 aa  550  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  74.67 
 
 		 310 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  73.25 
 
 		 314 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  69.26 
 
 		 326 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  70.1 
 
 		 315 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  68.75 
 
 		 318 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  65.12 
 
 		 315 aa  384  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  61.15 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  60.4 
 
 		 305 aa  349  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  58.3 
 
 		 284 aa  325  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  46.69 
 
 		 333 aa  268  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  49.14 
 
 		 333 aa  265  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  47.83 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  49.17 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  41.28 
 
 		 573 aa  246  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  47.4 
 
 		 310 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  45.67 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  43.92 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  45.97 
 
 		 310 aa  225  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  41.86 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  41.85 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  43.62 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0351  hypothetical protein  41.81 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  41.98 
 
 		 331 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0369  hypothetical protein  42.08 
 
 		 328 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0378  hypothetical protein  42.08 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  35.41 
 
 		 328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  32.34 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  35.71 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  33.66 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  33.67 
 
 		 380 aa  125  9e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  32 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  30.04 
 
 		 337 aa  123  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  31.19 
 
 		 340 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  30.58 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  31.19 
 
 		 352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  31.19 
 
 		 340 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  30.89 
 
 		 352 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  30.89 
 
 		 340 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  30.58 
 
 		 352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  28.79 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  28.62 
 
 		 340 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  32.26 
 
 		 355 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  30.71 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  29.5 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  29.5 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  31.19 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  30.04 
 
 		 372 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  28.37 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  30.58 
 
 		 352 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  26.91 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  28.62 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  30.43 
 
 		 324 aa  99.4  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  26.3 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  26.3 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  26.88 
 
 		 361 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  26.24 
 
 		 354 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  28.52 
 
 		 355 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1432  hypothetical protein  28 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  25.7 
 
 		 348 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  26.69 
 
 		 352 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  27.55 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  27.37 
 
 		 346 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  41.03 
 
 		 377 aa  90.1  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  28.67 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  27.37 
 
 		 361 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  27.37 
 
 		 361 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  29.64 
 
 		 361 aa  89  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  31.27 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  30.39 
 
 		 351 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  27.31 
 
 		 360 aa  86.7  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  29.23 
 
 		 340 aa  85.9  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  27.34 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  26.82 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  30.91 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  26.18 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  27.34 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  26.13 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  26.2 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  27.35 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  26.13 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  30.29 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  26.13 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  26.98 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>