242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4081 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  73.46 
 
 		 310 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  71.94 
 
 		 316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  71.61 
 
 		 316 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  71.61 
 
 		 316 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  71.61 
 
 		 316 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  70.51 
 
 		 316 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  75 
 
 		 314 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  70.23 
 
 		 316 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  69.9 
 
 		 316 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  69.26 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  69.58 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  65 
 
 		 318 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  61.39 
 
 		 315 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  64.44 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  62.5 
 
 		 313 aa  363  3e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  58.75 
 
 		 305 aa  345  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  58.3 
 
 		 284 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  48.15 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  50.66 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  48.08 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  44.48 
 
 		 573 aa  252  6e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  47.4 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  47.24 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  45.33 
 
 		 310 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  42.67 
 
 		 319 aa  228  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  42.81 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  41.12 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  43.05 
 
 		 310 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  45.74 
 
 		 331 aa  198  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0351  hypothetical protein  40.37 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  42.05 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  39.45 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0369  hypothetical protein  44.05 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0378  hypothetical protein  43.65 
 
 		 328 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  35.97 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  34.34 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  33.77 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  32.3 
 
 		 380 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  32.85 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  29.14 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  32.23 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  29.83 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  27.06 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  27.99 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  27.99 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  28.3 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  30.68 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  26.62 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  27.8 
 
 		 361 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  29.1 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  29.35 
 
 		 355 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  30.08 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  28.79 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  31.09 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  28.41 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  28.41 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  30 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  28.03 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  28.03 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  28.03 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  28.03 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  27.65 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  28.04 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  27.94 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  28.04 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  27.68 
 
 		 356 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  28.68 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  27.68 
 
 		 356 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  30.58 
 
 		 325 aa  96.3  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  28.62 
 
 		 329 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  27.68 
 
 		 420 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  28.62 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  28.41 
 
 		 352 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  37.74 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  28.03 
 
 		 340 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  26.57 
 
 		 357 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  25.99 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  26.77 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  26.77 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  26.77 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  26.77 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  26.77 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  27.6 
 
 		 351 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  25.56 
 
 		 363 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  26.77 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  27.73 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  26.77 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  26.77 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  27.73 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  25.09 
 
 		 361 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  25.09 
 
 		 361 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  26.77 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  30.05 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  25.09 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  26.89 
 
 		 327 aa  89  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  26.89 
 
 		 355 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  28.36 
 
 		 357 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1253  membrane-fusion protein  26.89 
 
 		 331 aa  86.7  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0469672  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  26.26 
 
 		 365 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>