249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004026 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  100 
 
 		 305 aa  596  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  87.99 
 
 		 284 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  68.44 
 
 		 313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  60.4 
 
 		 316 aa  361  8e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  59.41 
 
 		 316 aa  358  9e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  59.41 
 
 		 316 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  59.93 
 
 		 316 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  58.75 
 
 		 326 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  59.08 
 
 		 316 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  59.93 
 
 		 316 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  59.93 
 
 		 316 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  59.6 
 
 		 316 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  59.6 
 
 		 316 aa  353  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  60.14 
 
 		 310 aa  350  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  56.9 
 
 		 315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  59.78 
 
 		 318 aa  333  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  58.61 
 
 		 314 aa  332  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  55.78 
 
 		 315 aa  308  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  51.01 
 
 		 333 aa  271  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  46.75 
 
 		 333 aa  266  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  44.67 
 
 		 573 aa  250  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  46.33 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  46.78 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  48.59 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  45.97 
 
 		 310 aa  242  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  45.42 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  42.52 
 
 		 319 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  44.44 
 
 		 322 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  45.92 
 
 		 334 aa  235  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  42.86 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  45.17 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0351  hypothetical protein  41.84 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0369  hypothetical protein  44.22 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0378  hypothetical protein  44.22 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  37.23 
 
 		 328 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  36.96 
 
 		 335 aa  152  5e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  32.89 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  32.11 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  33.45 
 
 		 372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  31.99 
 
 		 380 aa  135  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  32.85 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  32.46 
 
 		 360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  31.47 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  32.46 
 
 		 360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  30.39 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  32.87 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  29.25 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  29.44 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  30.11 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  31.52 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  26.16 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  27.78 
 
 		 354 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  30.77 
 
 		 352 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  30.19 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  26.49 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  29.5 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  31.77 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  31.34 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  39.08 
 
 		 377 aa  105  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  28.9 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  29.12 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  28.03 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  28.9 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  26.18 
 
 		 361 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  28.72 
 
 		 352 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  28.52 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  28.72 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  27.76 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  27.76 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  25.91 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  25.91 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  29.8 
 
 		 351 aa  99  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  28.04 
 
 		 368 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  24.82 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  28.91 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  28.17 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  28.57 
 
 		 360 aa  96.3  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  26.26 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  25.45 
 
 		 358 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  25.45 
 
 		 343 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  26.49 
 
 		 355 aa  95.5  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  28.16 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  27.34 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  27.34 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  27.34 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  27.34 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  27.34 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  26.55 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  28.52 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  26.67 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  28.52 
 
 		 352 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  26.67 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  26.67 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  26.67 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  28.02 
 
 		 327 aa  93.2  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  26.67 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  26.67 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  26.67 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  26.67 
 
 		 349 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>