230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0187 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  77.78 
 
 		 322 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  68.93 
 
 		 310 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  57.38 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  55.92 
 
 		 310 aa  318  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  48.11 
 
 		 333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  48.95 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  46.34 
 
 		 573 aa  250  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  45.6 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  46.31 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  43.33 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  42.72 
 
 		 316 aa  225  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  44.75 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  42.38 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  42.38 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  42.05 
 
 		 316 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  43.29 
 
 		 316 aa  221  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  42.05 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  44.48 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  42.95 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  43.29 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0351  hypothetical protein  47.32 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  39.67 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  43.64 
 
 		 310 aa  215  9e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  41.3 
 
 		 315 aa  215  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  42.86 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  44.16 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  42.05 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  44.68 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  43.6 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  42.75 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0378  hypothetical protein  46.85 
 
 		 328 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0369  hypothetical protein  46.54 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  41.92 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  36.72 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  33.79 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  33.66 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  33.58 
 
 		 335 aa  125  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  30.96 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  31.69 
 
 		 380 aa  116  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  41.71 
 
 		 372 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  37.79 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  30.09 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  30.09 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  30.09 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  30.09 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  37.36 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  30.51 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  28.77 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  28.77 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  27.37 
 
 		 338 aa  105  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  28.43 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  29.25 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  33.85 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  29.15 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  31.4 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  29.23 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  29.23 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  30.54 
 
 		 340 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  30.99 
 
 		 352 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  30.99 
 
 		 340 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  27.47 
 
 		 329 aa  96.3  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  30 
 
 		 355 aa  96.3  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  30.58 
 
 		 352 aa  95.9  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  30.58 
 
 		 340 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  26.03 
 
 		 354 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  27.85 
 
 		 348 aa  94.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  26.37 
 
 		 348 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  32.11 
 
 		 365 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  30.96 
 
 		 352 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  29.87 
 
 		 361 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  34.02 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  29.5 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  31.4 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  29.5 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  29.5 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  32.57 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  27.39 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  30.24 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  27.04 
 
 		 355 aa  90.5  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  31.54 
 
 		 339 aa  89.7  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  30.24 
 
 		 345 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  25.47 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  30.73 
 
 		 353 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  31.19 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  27.88 
 
 		 359 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  32.37 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  26.73 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  31.03 
 
 		 411 aa  86.7  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  26.77 
 
 		 361 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  30.36 
 
 		 340 aa  85.9  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  31.65 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  27.48 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  26.56 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  29.45 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  29.41 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  26.57 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  30.32 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  26.39 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  32.45 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>