247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2004 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  649    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  53.98 
 
 		 333 aa  295  8e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  51.57 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  50.85 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  50 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  49.83 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  50 
 
 		 313 aa  264  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  48.77 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  53.14 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  45.45 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  48.81 
 
 		 319 aa  255  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  50 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  47.73 
 
 		 284 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  46.76 
 
 		 310 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  46.44 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  48.95 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  44.37 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  41.12 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  41.85 
 
 		 316 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  43.2 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  45.02 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  45.77 
 
 		 316 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  45.77 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  40.12 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  45.77 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  45.77 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  39.81 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  39.81 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  42.81 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  45.02 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0351  hypothetical protein  41.34 
 
 		 328 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  45.05 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0369  hypothetical protein  46.03 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0378  hypothetical protein  44.49 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  38.55 
 
 		 328 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  34.29 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  32.88 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  34.32 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  33.95 
 
 		 380 aa  132  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  30.06 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  39.2 
 
 		 372 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  28.35 
 
 		 338 aa  122  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  28.57 
 
 		 355 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  36.52 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  26.98 
 
 		 329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  31.08 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  31.08 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  29.46 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  29.55 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  29.55 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  28.33 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  28.15 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  30.61 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  29.55 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  29.78 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  28.33 
 
 		 355 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  25.48 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  30.04 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  30.66 
 
 		 420 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  31.99 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  30.04 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  31.99 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  28.73 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  29.37 
 
 		 343 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  27.52 
 
 		 357 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  30.11 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  29.18 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  28.47 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  28.21 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  26.69 
 
 		 348 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  45.61 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  30.4 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  27.07 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  27.07 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  27.07 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  26.14 
 
 		 365 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  27.07 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  27.07 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  27.11 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  27.11 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  27.11 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  27.11 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  27.11 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  29.89 
 
 		 353 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  27.11 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  27.11 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  27.11 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  27.83 
 
 		 368 aa  99.4  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  28.95 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  25.54 
 
 		 327 aa  97.1  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  25.92 
 
 		 411 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  33.19 
 
 		 331 aa  96.3  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  26.94 
 
 		 336 aa  95.9  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  26.56 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  28.1 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  23.21 
 
 		 360 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  23.21 
 
 		 360 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  25 
 
 		 354 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  29.43 
 
 		 355 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.35937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>