234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4241 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  99.37 
 
 
316 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  99.37 
 
 
316 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  99.37 
 
 
316 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  93.35 
 
 
316 aa  591  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  88.61 
 
 
316 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  88.61 
 
 
316 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  87.66 
 
 
316 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  86.39 
 
 
316 aa  551  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  72.96 
 
 
310 aa  454  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  71.94 
 
 
326 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  73.57 
 
 
314 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  67.09 
 
 
315 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  70 
 
 
318 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  64.45 
 
 
315 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  61.15 
 
 
313 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  59.6 
 
 
305 aa  346  4e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  57.95 
 
 
284 aa  325  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  46.5 
 
 
333 aa  279  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  48.48 
 
 
333 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  47.4 
 
 
311 aa  266  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  49.51 
 
 
334 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  42.95 
 
 
573 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  47.06 
 
 
310 aa  245  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  45.86 
 
 
310 aa  231  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  42.67 
 
 
310 aa  222  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  43.55 
 
 
322 aa  222  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  41.78 
 
 
319 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  45.77 
 
 
330 aa  215  8e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  42.05 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0351  hypothetical protein  42.62 
 
 
328 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  43.02 
 
 
331 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0378  hypothetical protein  39.87 
 
 
328 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0369  hypothetical protein  42.47 
 
 
328 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  35.66 
 
 
328 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  31.77 
 
 
335 aa  143  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  36.53 
 
 
335 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  33.85 
 
 
380 aa  133  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  33.55 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  32.03 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  32.38 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  30.48 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  29.74 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  29.64 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  30.48 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  30.11 
 
 
352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  30.11 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  29 
 
 
352 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  31.58 
 
 
355 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  31.92 
 
 
340 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  29.3 
 
 
338 aa  106  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  27.87 
 
 
339 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  29.2 
 
 
360 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  29.2 
 
 
360 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  28.84 
 
 
337 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  30.11 
 
 
340 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  29.37 
 
 
352 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  29.59 
 
 
355 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  34.07 
 
 
372 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  29.37 
 
 
352 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  26.74 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  27.31 
 
 
348 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  29.89 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  26.51 
 
 
354 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  29.77 
 
 
324 aa  95.5  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  28.21 
 
 
361 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  35.26 
 
 
377 aa  93.6  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  27.34 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  27.34 
 
 
361 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  27.34 
 
 
361 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  27.69 
 
 
356 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  27.65 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  25.91 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  25.91 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  27.69 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  28.7 
 
 
351 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  31.25 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1432  hypothetical protein  28.29 
 
 
342 aa  87  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  27.31 
 
 
356 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  27.31 
 
 
356 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  27.85 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  27.85 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  27.85 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  27.85 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  27.85 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  27.85 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  27.85 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  27.85 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  31.65 
 
 
336 aa  85.9  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  27.85 
 
 
349 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  27.08 
 
 
349 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  29.68 
 
 
361 aa  85.9  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  27.08 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  27.08 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  27.08 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  28.52 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  27.08 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  26.42 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  26.52 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  27.72 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>