235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4061 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  98.73 
 
 
316 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  98.42 
 
 
316 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  93.67 
 
 
316 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  88.29 
 
 
316 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  87.97 
 
 
316 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  87.97 
 
 
316 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  87.66 
 
 
316 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  86.71 
 
 
316 aa  551  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  74.59 
 
 
310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  73.25 
 
 
314 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  69.58 
 
 
326 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  69.41 
 
 
318 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  70.43 
 
 
315 aa  393  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  64.78 
 
 
315 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  61.15 
 
 
313 aa  368  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  59.08 
 
 
305 aa  344  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  59.01 
 
 
284 aa  333  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  48.01 
 
 
333 aa  272  7e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  48.97 
 
 
333 aa  264  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  49.5 
 
 
334 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  46.91 
 
 
311 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  43.2 
 
 
573 aa  249  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  47.08 
 
 
310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  46.58 
 
 
310 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  43.24 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  47 
 
 
310 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  41.2 
 
 
319 aa  215  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  40.12 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  43.29 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0351  hypothetical protein  41.41 
 
 
328 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  41.6 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0369  hypothetical protein  41.7 
 
 
328 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0378  hypothetical protein  41.7 
 
 
328 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  36.29 
 
 
328 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  32.01 
 
 
335 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  33.22 
 
 
335 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  33.66 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  32.51 
 
 
380 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  32.68 
 
 
337 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  32.74 
 
 
344 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  30.5 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  30.5 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  31.21 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  30.48 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  30.14 
 
 
352 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  30.85 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  28.52 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  29.85 
 
 
352 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  30.34 
 
 
337 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  28.25 
 
 
340 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  29.6 
 
 
360 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  28 
 
 
340 aa  107  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  29.6 
 
 
360 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  27.92 
 
 
339 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  30.5 
 
 
340 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  29.68 
 
 
352 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  30.79 
 
 
355 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  29.97 
 
 
372 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  26.98 
 
 
361 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  31.03 
 
 
341 aa  99.8  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  30.6 
 
 
324 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  27.05 
 
 
331 aa  95.5  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  27.05 
 
 
331 aa  95.5  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  25.7 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  25.7 
 
 
348 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  28.14 
 
 
346 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  26.69 
 
 
352 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  28.14 
 
 
361 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  28.14 
 
 
361 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  28.08 
 
 
355 aa  92.8  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  30.8 
 
 
336 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  38.89 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  27.55 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  27.55 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  27.55 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  27.55 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  27.55 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  27.55 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  27.55 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1432  hypothetical protein  29.52 
 
 
342 aa  90.5  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  27.55 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  27.55 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  28.08 
 
 
356 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  30.14 
 
 
361 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  27.46 
 
 
341 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  28.08 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  27.69 
 
 
356 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  27.69 
 
 
356 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  28.08 
 
 
340 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  26.6 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  27.98 
 
 
336 aa  86.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  26.6 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  26.6 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  26.6 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  26.6 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  30.37 
 
 
355 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  31.36 
 
 
334 aa  85.9  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  27.31 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  26.89 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>