252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1432 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1432  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  666    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0264  hypothetical protein  53.04 
 
 
347 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1253  membrane-fusion protein  57.76 
 
 
331 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0469672  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  47.84 
 
 
327 aa  233  3e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  42.86 
 
 
340 aa  230  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  42.12 
 
 
340 aa  220  3.9999999999999997e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  43.03 
 
 
349 aa  208  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  43.03 
 
 
349 aa  208  9e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  43.03 
 
 
349 aa  208  9e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  43.03 
 
 
349 aa  208  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  43.03 
 
 
349 aa  208  9e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  43.03 
 
 
349 aa  208  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  43.03 
 
 
349 aa  208  9e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  43.03 
 
 
349 aa  208  9e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  43.03 
 
 
349 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  42.86 
 
 
348 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  40.88 
 
 
325 aa  205  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  38.87 
 
 
355 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  43.1 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  43.1 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  43.1 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  43.1 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  43.1 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  38.31 
 
 
411 aa  199  7e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  40.43 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  37.89 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  41.38 
 
 
362 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  35.48 
 
 
357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  36.98 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  38.64 
 
 
368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  36.92 
 
 
359 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  42.61 
 
 
355 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  42.61 
 
 
355 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  39.29 
 
 
359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  38.54 
 
 
361 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  38.2 
 
 
362 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  38.2 
 
 
362 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  38.2 
 
 
362 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  36.96 
 
 
361 aa  175  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  32.37 
 
 
361 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  34.22 
 
 
358 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  33.43 
 
 
361 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  33.43 
 
 
361 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  35.28 
 
 
343 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  34.44 
 
 
346 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  32.21 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  36.68 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  41.76 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  39.64 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  39.64 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  38.67 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  38.97 
 
 
365 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  34.13 
 
 
356 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  34.13 
 
 
356 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  33.03 
 
 
353 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  34.14 
 
 
356 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  32.73 
 
 
353 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  33.53 
 
 
356 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  33.53 
 
 
420 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  34.84 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  38.37 
 
 
343 aa  156  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2241  hypothetical protein  37.5 
 
 
361 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5197  hypothetical protein  37.07 
 
 
365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  32.75 
 
 
365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  33.63 
 
 
355 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  39.63 
 
 
336 aa  152  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2283  hypothetical protein  34.78 
 
 
362 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2068  hypothetical protein  33.84 
 
 
353 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  34.67 
 
 
355 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  35.62 
 
 
360 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  35.62 
 
 
360 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  32.9 
 
 
355 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  35.84 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  32.25 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  33.46 
 
 
352 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  33.85 
 
 
352 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  33.46 
 
 
352 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  30.81 
 
 
340 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  30.81 
 
 
340 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  31.1 
 
 
340 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  33.46 
 
 
340 aa  122  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  33.46 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  33.45 
 
 
324 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  30.66 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  31.97 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  32.71 
 
 
340 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  30.1 
 
 
339 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  33.83 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1051  hypothetical protein  32.94 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00435413  normal  0.0767092 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1111  hypothetical protein  33.64 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00425236  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  33.83 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  29.12 
 
 
337 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  30.51 
 
 
348 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0954  hypothetical protein  32.94 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.006029  normal  0.0131459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  33.21 
 
 
337 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0848  hypothetical protein  35.63 
 
 
338 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  28.25 
 
 
284 aa  105  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  29.59 
 
 
340 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  32.05 
 
 
345 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  30.06 
 
 
369 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>