248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2038 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  56.79 
 
 
369 aa  352  7e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  55.31 
 
 
340 aa  326  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  53.82 
 
 
348 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  46.04 
 
 
331 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  49.84 
 
 
342 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4024  hypothetical protein  53.12 
 
 
346 aa  276  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.819809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1827  conserved hypothetical protein 698  47.02 
 
 
346 aa  264  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.811331  normal  0.978581 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8353  hypothetical protein  47.53 
 
 
346 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  49.53 
 
 
343 aa  259  6e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0153  hypothetical protein  47.69 
 
 
345 aa  259  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  46.98 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0042  hypothetical protein  46.5 
 
 
372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1861  hypothetical protein  46.5 
 
 
372 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00940925  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3353  hypothetical protein  45.02 
 
 
341 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2170  hypothetical protein  48.11 
 
 
364 aa  246  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242299 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1009  hypothetical protein  47.62 
 
 
338 aa  238  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1641  hypothetical protein  47.62 
 
 
338 aa  238  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4276  hypothetical protein  47.62 
 
 
338 aa  238  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.745778  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3144  hypothetical protein  50.5 
 
 
332 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4010  hypothetical protein  46.37 
 
 
339 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3881  hypothetical protein  50.17 
 
 
332 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2894  hypothetical protein  39.31 
 
 
351 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.380693  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1667  hypothetical protein  40.92 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2706  hypothetical protein  39.87 
 
 
351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  37.18 
 
 
355 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  37.59 
 
 
361 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  37.59 
 
 
361 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  37.59 
 
 
346 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2449  hypothetical protein  40.14 
 
 
359 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  32.49 
 
 
338 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  32.81 
 
 
360 aa  152  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  32.81 
 
 
360 aa  152  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  37.73 
 
 
361 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  38.2 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  35.42 
 
 
324 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  33.56 
 
 
348 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  38.2 
 
 
353 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  32.21 
 
 
357 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  38.41 
 
 
365 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  40.21 
 
 
356 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  27.44 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  37.5 
 
 
358 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  37.5 
 
 
343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  38.13 
 
 
353 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2068  hypothetical protein  38.58 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  33.23 
 
 
348 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  34.65 
 
 
349 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  34.65 
 
 
349 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  34.65 
 
 
349 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  34.65 
 
 
349 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  34.65 
 
 
349 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  34.65 
 
 
349 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  34.65 
 
 
349 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  34.65 
 
 
349 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  34.65 
 
 
349 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  33.77 
 
 
339 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  39.86 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  31.83 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  39.41 
 
 
355 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  31.96 
 
 
355 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  30.37 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  34.69 
 
 
349 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  34.69 
 
 
349 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  34.69 
 
 
349 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  34.69 
 
 
349 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  34.69 
 
 
349 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  38.29 
 
 
355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  35.67 
 
 
343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  31.45 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  31.44 
 
 
343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  36.96 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  35.4 
 
 
359 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  34.08 
 
 
340 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  31.11 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  31.13 
 
 
352 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  32.99 
 
 
352 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  31.01 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  31.23 
 
 
340 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  32.1 
 
 
368 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  31.13 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  31.13 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  31.35 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  30.7 
 
 
352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  31.13 
 
 
340 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  31.45 
 
 
352 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  34.01 
 
 
411 aa  126  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  34.66 
 
 
362 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  30.26 
 
 
337 aa  126  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  34.67 
 
 
361 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  33.08 
 
 
348 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  34.38 
 
 
359 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  33.69 
 
 
336 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  28.22 
 
 
365 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5197  hypothetical protein  33.73 
 
 
365 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  28.22 
 
 
365 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  34.72 
 
 
362 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>