245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2274 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  583  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  54.49 
 
 		 336 aa  259  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  54.49 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  53 
 
 		 346 aa  255  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  50.33 
 
 		 362 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  51.54 
 
 		 356 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  50.35 
 
 		 356 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  53.76 
 
 		 341 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  51.42 
 
 		 360 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  51.29 
 
 		 365 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  45.7 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  50.53 
 
 		 350 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  51.42 
 
 		 348 aa  225  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4549  hypothetical protein  50 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1346  hypothetical protein  45.58 
 
 		 346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.483374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0950  hypothetical protein  48.17 
 
 		 353 aa  202  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  35.62 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  33.22 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  33.82 
 
 		 352 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  32.29 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  31.42 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 355 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  32.75 
 
 		 354 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  31.13 
 
 		 340 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  29.67 
 
 		 355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  30.04 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  31.46 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  31.46 
 
 		 352 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  31.46 
 
 		 340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  29.25 
 
 		 377 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  31.13 
 
 		 352 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  31.13 
 
 		 340 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  31.13 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  30.79 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  31.13 
 
 		 340 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  29.89 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  31.13 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  29.33 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  27.5 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  32.58 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  30.25 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  29.71 
 
 		 346 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  34.44 
 
 		 341 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  29.71 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  29.71 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  37.63 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  32.35 
 
 		 340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  33.22 
 
 		 351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  30.8 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  33.57 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  33.57 
 
 		 343 aa  109  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  30.33 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  30.4 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  30.4 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  28.67 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  30.19 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  29.9 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  30.56 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  28.07 
 
 		 349 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  30.6 
 
 		 340 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  29.37 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  27.72 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  27.72 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  27.72 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  27.72 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  30.12 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  29.17 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  30.21 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09940  predicted membrane protein  34.83 
 
 		 441 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.903662  normal  0.219021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  30.99 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  29.96 
 
 		 326 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  28.27 
 
 		 344 aa  102  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  28.76 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  30.47 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  31.1 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  28.12 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  26.16 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  30.42 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  31.25 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  30.36 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4010  hypothetical protein  32.62 
 
 		 339 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  29.55 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  33.07 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  31.21 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  30.21 
 
 		 353 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  30.1 
 
 		 361 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  28.81 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  31.25 
 
 		 355 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  28.42 
 
 		 390 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  30.77 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>