250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6450 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  85.42 
 
 
356 aa  541  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  77.26 
 
 
362 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  69.69 
 
 
350 aa  378  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  69.43 
 
 
356 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  67.72 
 
 
360 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  67.06 
 
 
365 aa  352  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  59.53 
 
 
336 aa  330  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  59.82 
 
 
346 aa  322  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4549  hypothetical protein  69.04 
 
 
373 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  61.59 
 
 
312 aa  315  9e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  51.5 
 
 
339 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1346  hypothetical protein  47.92 
 
 
346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.483374 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  53.85 
 
 
341 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0950  hypothetical protein  56.33 
 
 
353 aa  245  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  50 
 
 
304 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  34.7 
 
 
340 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  35.46 
 
 
352 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  35.46 
 
 
340 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  35.46 
 
 
352 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  35.11 
 
 
352 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  34.75 
 
 
340 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  35.11 
 
 
340 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  33.97 
 
 
340 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  35.57 
 
 
360 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  35.57 
 
 
360 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  34.29 
 
 
340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  35.46 
 
 
352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  33.33 
 
 
337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  32.27 
 
 
337 aa  147  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  35.87 
 
 
355 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  35.1 
 
 
348 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  32.83 
 
 
355 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  33.33 
 
 
346 aa  143  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  35.29 
 
 
354 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  35.76 
 
 
339 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  35.88 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  33.79 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  32.5 
 
 
335 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  30.56 
 
 
335 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  29.39 
 
 
377 aa  129  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  30.34 
 
 
331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  35.17 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  30.66 
 
 
341 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  28.14 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1827  conserved hypothetical protein 698  33.33 
 
 
346 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.811331  normal  0.978581 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  32.37 
 
 
341 aa  125  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  37.08 
 
 
372 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  33.03 
 
 
380 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  32.89 
 
 
345 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  35.76 
 
 
343 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  29.37 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  34.36 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1009  hypothetical protein  37.15 
 
 
338 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1641  hypothetical protein  37.15 
 
 
338 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4276  hypothetical protein  37.15 
 
 
338 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.745778  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4010  hypothetical protein  38.78 
 
 
339 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115969  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  31.47 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  30.53 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  29.7 
 
 
340 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  33.22 
 
 
355 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  33.78 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  32.25 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  32.25 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  32.92 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  29.22 
 
 
362 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  32.93 
 
 
368 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  34.03 
 
 
347 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  33.46 
 
 
361 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  34.39 
 
 
343 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  32.12 
 
 
359 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  28.57 
 
 
363 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  28.23 
 
 
348 aa  107  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  28.93 
 
 
343 aa  106  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  32.43 
 
 
361 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  30.49 
 
 
331 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  27.53 
 
 
325 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3881  hypothetical protein  38.35 
 
 
332 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  33.82 
 
 
326 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  28.75 
 
 
352 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3144  hypothetical protein  38.35 
 
 
332 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  31.27 
 
 
322 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  30.36 
 
 
329 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  33.97 
 
 
336 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  32.48 
 
 
340 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  29.31 
 
 
357 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  28.62 
 
 
349 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  28.62 
 
 
349 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  28.35 
 
 
340 aa  100  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  28.62 
 
 
349 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  28.62 
 
 
349 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0127  hypothetical protein  28.78 
 
 
339 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  28.62 
 
 
349 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  34.24 
 
 
334 aa  100  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0153  hypothetical protein  34.06 
 
 
345 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  32.14 
 
 
331 aa  99.8  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  30.34 
 
 
362 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  30.34 
 
 
362 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  30.34 
 
 
362 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  31.85 
 
 
365 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>