247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6400 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6400  membrane protein-like protein  100 
 
 
472 aa  874    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1340  hypothetical protein  42.01 
 
 
411 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  36.81 
 
 
355 aa  189  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  37.15 
 
 
355 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  35.68 
 
 
339 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09940  predicted membrane protein  39.26 
 
 
441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.903662  normal  0.219021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  37.35 
 
 
324 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  34.38 
 
 
348 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  34.84 
 
 
360 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  34.84 
 
 
360 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  40.18 
 
 
347 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  34.3 
 
 
354 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2130  hypothetical protein  39.78 
 
 
374 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000290153  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  41.28 
 
 
352 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  27.75 
 
 
377 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  25.82 
 
 
337 aa  124  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3594  conserved hypothetical protein 698  48.84 
 
 
335 aa  123  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348147  normal  0.225581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  30.45 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  29.72 
 
 
348 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  36.91 
 
 
351 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0054  hypothetical protein  34.69 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  29.91 
 
 
363 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  28.22 
 
 
355 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  29.23 
 
 
340 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  27.93 
 
 
345 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  44.12 
 
 
361 aa  113  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  33.46 
 
 
343 aa  113  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  35.94 
 
 
360 aa  111  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  31.81 
 
 
356 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11040  predicted membrane protein  38.69 
 
 
363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  30.16 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  28.91 
 
 
361 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  31.93 
 
 
350 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  34.51 
 
 
359 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  35.27 
 
 
327 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  28.51 
 
 
331 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  32.18 
 
 
329 aa  106  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  26.52 
 
 
341 aa  106  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  31.52 
 
 
360 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  38.31 
 
 
360 aa  106  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  38.31 
 
 
360 aa  106  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  23.61 
 
 
338 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  27.19 
 
 
340 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  35.24 
 
 
343 aa  105  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  28.61 
 
 
411 aa  103  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  38.93 
 
 
336 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  36.45 
 
 
361 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  26.88 
 
 
352 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  26.88 
 
 
340 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  31.85 
 
 
348 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  26.88 
 
 
340 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  30.12 
 
 
365 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  27.88 
 
 
349 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  26.88 
 
 
352 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  26.56 
 
 
340 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  27.88 
 
 
349 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  27.88 
 
 
349 aa  100  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  25.63 
 
 
340 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  27.88 
 
 
349 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  27.88 
 
 
349 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  27.88 
 
 
349 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  27.88 
 
 
349 aa  100  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  27.88 
 
 
349 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  26.9 
 
 
349 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  26.88 
 
 
352 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  27.19 
 
 
340 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  27.73 
 
 
368 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  31.55 
 
 
357 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  27.19 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  25.29 
 
 
328 aa  97.8  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  34.27 
 
 
361 aa  97.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  27.76 
 
 
348 aa  97.1  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  28.42 
 
 
345 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  26.16 
 
 
352 aa  95.9  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  33.68 
 
 
341 aa  95.9  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  33.86 
 
 
362 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  28.66 
 
 
340 aa  94.7  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  34.76 
 
 
340 aa  95.1  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  34.58 
 
 
362 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  27.22 
 
 
348 aa  94.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  34.58 
 
 
362 aa  94.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  34.58 
 
 
362 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  27.46 
 
 
349 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  27.46 
 
 
349 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  27.46 
 
 
349 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  36.16 
 
 
336 aa  94.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  27.46 
 
 
349 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  27.46 
 
 
349 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  33.95 
 
 
325 aa  94  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2706  hypothetical protein  34.26 
 
 
351 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  23.28 
 
 
335 aa  92.8  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  32.96 
 
 
360 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  28.06 
 
 
361 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  28.06 
 
 
361 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  30.95 
 
 
344 aa  91.3  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  30.04 
 
 
365 aa  91.3  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  30.86 
 
 
331 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  35.35 
 
 
372 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  30.04 
 
 
365 aa  91.3  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  28.62 
 
 
346 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>