248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3594 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3594  conserved hypothetical protein 698  100 
 
 		 335 aa  608  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348147  normal  0.225581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  51.05 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6400  membrane protein-like protein  40.67 
 
 		 472 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2130  hypothetical protein  44.06 
 
 		 374 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000290153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1340  hypothetical protein  40.78 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  48.55 
 
 		 361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  37.77 
 
 		 355 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  38.99 
 
 		 355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  39.93 
 
 		 354 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  35.52 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  35.52 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  40.29 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  39.42 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  39.85 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  38.41 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11040  predicted membrane protein  45.95 
 
 		 363 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09940  predicted membrane protein  41.54 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.903662  normal  0.219021 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  33.79 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  32.16 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  38.36 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  32.54 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  32.54 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  32.54 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  32.54 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  32.54 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  32.54 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  32.54 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  32.54 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  32.54 
 
 		 349 aa  132  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6041  hypothetical protein  49.78 
 
 		 288 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  30.28 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  31.61 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  31.61 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  31.61 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  31.61 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  31.61 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  31.05 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  35.69 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  34.16 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  36.65 
 
 		 356 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  29.13 
 
 		 340 aa  125  9e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  35.18 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  35.67 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  38.7 
 
 		 365 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  29.39 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  30.53 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  35.89 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  38.17 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0054  hypothetical protein  35.33 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  35.64 
 
 		 343 aa  119  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2170  hypothetical protein  35.56 
 
 		 364 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  30.46 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  31.23 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  31.3 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  33.45 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  35.14 
 
 		 336 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  30.33 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  31.86 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  32.76 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  32.76 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  27.58 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  37.14 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  31.27 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  31.48 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  34.17 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  34.17 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  30.51 
 
 		 368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  27.71 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  35.37 
 
 		 360 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  34.77 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  31.17 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  30.92 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  27.46 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  39.01 
 
 		 348 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  32.06 
 
 		 343 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  32.9 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  31.58 
 
 		 316 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  30.55 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  31.93 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  31.93 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  32.08 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  30.33 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  29.94 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3353  hypothetical protein  35.36 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4549  hypothetical protein  36.53 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  33.92 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  25 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  30.7 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  36.43 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  30.26 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  29.89 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  39.62 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  32.88 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  32.46 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  30.64 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  29.89 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  29.57 
 
 		 361 aa  110  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  31.7 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  34.82 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>