245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1340 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1340  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  787    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  45.48 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2130  hypothetical protein  45.58 
 
 		 374 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000290153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6400  membrane protein-like protein  40.77 
 
 		 472 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  34.37 
 
 		 355 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  40.57 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  43.09 
 
 		 355 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  32.88 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  32.88 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  33.15 
 
 		 348 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  32.42 
 
 		 354 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09940  predicted membrane protein  38.06 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.903662  normal  0.219021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  42.45 
 
 		 352 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  43.21 
 
 		 339 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  27.52 
 
 		 377 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  31.49 
 
 		 324 aa  129  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  38.91 
 
 		 343 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11040  predicted membrane protein  39.49 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6041  hypothetical protein  41.81 
 
 		 288 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  27.66 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0054  hypothetical protein  34.9 
 
 		 380 aa  113  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3594  conserved hypothetical protein 698  49.23 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348147  normal  0.225581 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  28.31 
 
 		 352 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  28.31 
 
 		 340 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  35.22 
 
 		 368 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  29.06 
 
 		 340 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  28.01 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  37.65 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  37.65 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  28.01 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  25.6 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  30.61 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304105 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  28.16 
 
 		 349 aa  106  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  28.16 
 
 		 349 aa  106  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  28.16 
 
 		 349 aa  106  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  28.16 
 
 		 349 aa  106  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  28.16 
 
 		 349 aa  106  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  28.16 
 
 		 349 aa  106  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  28.16 
 
 		 349 aa  106  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  28.16 
 
 		 349 aa  106  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  28.34 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  28.12 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  33.83 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  33.83 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  33.83 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  33.06 
 
 		 325 aa  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1432  hypothetical protein  34.8 
 
 		 342 aa  103  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  33.5 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  34.9 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  31.39 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  25.76 
 
 		 357 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  29.97 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  34.87 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  34.87 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  28.5 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  27.72 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  28.31 
 
 		 340 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  31.88 
 
 		 348 aa  99.4  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  24.33 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  35.35 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  26.89 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  36.73 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  32.02 
 
 		 348 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0264  hypothetical protein  33.98 
 
 		 347 aa  97.8  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  33.2 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  28.01 
 
 		 352 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  36.28 
 
 		 355 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  34.38 
 
 		 337 aa  97.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  33.2 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  33.2 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  33.2 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  33.2 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  29.1 
 
 		 326 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  24.49 
 
 		 331 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  32.38 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  30.69 
 
 		 338 aa  95.1  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  37.99 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  36.41 
 
 		 348 aa  94  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  27.51 
 
 		 361 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0127  hypothetical protein  25.4 
 
 		 339 aa  94.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  27.51 
 
 		 361 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  39.13 
 
 		 336 aa  93.2  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  32.5 
 
 		 327 aa  92.8  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  33.9 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  35.86 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  35.32 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  27.86 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5197  hypothetical protein  34.71 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0042  hypothetical protein  32.29 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  27.58 
 
 		 356 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  27.58 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  23.82 
 
 		 341 aa  90.9  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  34.26 
 
 		 353 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  35.5 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  27.58 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  34.5 
 
 		 359 aa  90.5  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  26.44 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2706  hypothetical protein  33.85 
 
 		 351 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  28.08 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3353  hypothetical protein  35.87 
 
 		 341 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.199768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>